More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2536 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  75.85 
 
 		 564 aa  874    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  58.68 
 
 		 562 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  100 
 
 		 559 aa  1127    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  53.44 
 
 		 494 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  52.67 
 
 		 497 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  57.77 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  47.06 
 
 		 571 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  49.41 
 
 		 503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  49.3 
 
 		 531 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  49.3 
 
 		 496 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  49.3 
 
 		 496 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  48 
 
 		 503 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  39.86 
 
 		 636 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  44.95 
 
 		 530 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  47.94 
 
 		 489 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  47.94 
 
 		 489 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  50.3 
 
 		 500 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  44.96 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  44.96 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  44.22 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  45.4 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  47.62 
 
 		 503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  46.3 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  48.03 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  44.44 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  50.61 
 
 		 411 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  46.44 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  46.84 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  46.64 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  46.34 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  43.75 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  47.44 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  46.54 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  43.55 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  46.34 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  45.73 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  44.65 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  44.44 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  44.65 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  45.51 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  45.62 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  44.44 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  44.69 
 
 		 489 aa  389  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  44.69 
 
 		 489 aa  389  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  44.24 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  44.24 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  44.24 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  44.24 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  43.58 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  44.24 
 
 		 489 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  44.69 
 
 		 489 aa  389  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  45.31 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  44.04 
 
 		 489 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  44.04 
 
 		 489 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  45.31 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  43.35 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  45.92 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  42.51 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  44.98 
 
 		 488 aa  382  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  46.71 
 
 		 502 aa  382  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  42.51 
 
 		 497 aa  379  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  46.21 
 
 		 496 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  45.57 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.14 
 
 		 543 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  45.53 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  43.75 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  45.86 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  45.53 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  45.32 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  45.32 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  45.75 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  45.65 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  45.27 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  44.88 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  43.2 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  45.65 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  42.39 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  45.36 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  45.97 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  47.28 
 
 		 908 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  45.56 
 
 		 1007 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  45.66 
 
 		 489 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  45.66 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  45.05 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  45.65 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  44.29 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  43.29 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  40.77 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  45.51 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  41.5 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  44.94 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  48.89 
 
 		 990 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>