More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  64.67 
 
 		 974 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  69.73 
 
 		 1018 aa  685    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  68.3 
 
 		 1091 aa  662    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  69.84 
 
 		 922 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  61.89 
 
 		 1041 aa  675    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  72.98 
 
 		 1007 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  72.97 
 
 		 908 aa  679    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  61.5 
 
 		 1016 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  71.58 
 
 		 944 aa  706    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  76.18 
 
 		 1244 aa  678    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  72.42 
 
 		 1334 aa  740    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  66.34 
 
 		 1093 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  71.87 
 
 		 1194 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  73.42 
 
 		 952 aa  702    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  66.06 
 
 		 1040 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  100 
 
 		 959 aa  1875    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  72.39 
 
 		 1048 aa  664    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  71.61 
 
 		 1151 aa  702    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  71.65 
 
 		 1427 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  63.47 
 
 		 987 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  68.3 
 
 		 1058 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  74.67 
 
 		 1117 aa  724    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  69.37 
 
 		 1113 aa  710    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  72.83 
 
 		 1043 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  65.93 
 
 		 702 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  71.49 
 
 		 990 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  73.25 
 
 		 1070 aa  684    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  65.23 
 
 		 1123 aa  633  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  58.35 
 
 		 991 aa  635  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  58.35 
 
 		 991 aa  635  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  67.45 
 
 		 1024 aa  634  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  63.37 
 
 		 961 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  68.08 
 
 		 1080 aa  632  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  63.67 
 
 		 953 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  60.42 
 
 		 1022 aa  594  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  66.3 
 
 		 717 aa  595  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  51.17 
 
 		 1093 aa  589  1e-166  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  45.79 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  45.61 
 
 		 559 aa  346  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  40.82 
 
 		 636 aa  337  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  44.58 
 
 		 564 aa  337  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  44.21 
 
 		 562 aa  336  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  42.89 
 
 		 494 aa  336  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  43.13 
 
 		 531 aa  324  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  42.96 
 
 		 496 aa  324  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  41.41 
 
 		 503 aa  323  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.04 
 
 		 543 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  43.03 
 
 		 492 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  42.72 
 
 		 496 aa  320  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  41.78 
 
 		 503 aa  319  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  43 
 
 		 411 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  45.66 
 
 		 485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  45.52 
 
 		 485 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  42.79 
 
 		 500 aa  313  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  44.06 
 
 		 492 aa  310  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  42.34 
 
 		 571 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  39.23 
 
 		 530 aa  303  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  41.83 
 
 		 491 aa  303  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.67 
 
 		 483 aa  302  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  39.14 
 
 		 496 aa  301  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  39.14 
 
 		 496 aa  301  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  37.92 
 
 		 1056 aa  301  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  38.73 
 
 		 497 aa  300  9e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  45.07 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  40.38 
 
 		 499 aa  296  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  37.71 
 
 		 938 aa  295  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  41.46 
 
 		 497 aa  293  7e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  42.34 
 
 		 496 aa  293  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  44.85 
 
 		 490 aa  293  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  41.75 
 
 		 489 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  38.75 
 
 		 508 aa  292  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.46 
 
 		 497 aa  292  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  41.85 
 
 		 489 aa  293  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  41.5 
 
 		 489 aa  291  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  37.01 
 
 		 476 aa  291  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  41.22 
 
 		 503 aa  291  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  44 
 
 		 485 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  42.13 
 
 		 416 aa  291  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  43.75 
 
 		 485 aa  291  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  38.83 
 
 		 1012 aa  290  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  43.28 
 
 		 483 aa  290  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  40.67 
 
 		 517 aa  289  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  42 
 
 		 489 aa  289  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  43.53 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  43.5 
 
 		 492 aa  289  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  39.72 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  40.91 
 
 		 496 aa  289  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  37.98 
 
 		 1141 aa  289  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  43.75 
 
 		 485 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  43.75 
 
 		 485 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  44.25 
 
 		 485 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  40.2 
 
 		 485 aa  288  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  37.83 
 
 		 1102 aa  288  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  36.74 
 
 		 1175 aa  287  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1573  ribonuclease  38.11 
 
 		 1128 aa  287  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  43.89 
 
 		 487 aa  286  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  37.86 
 
 		 528 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  41.79 
 
 		 490 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  39.01 
 
 		 483 aa  286  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  39.67 
 
 		 515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>