More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1200 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 496 aa  1000    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  46.21 
 
 		 559 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  44.77 
 
 		 564 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  44.7 
 
 		 562 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  41.45 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  38.24 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  43.12 
 
 		 571 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  41.33 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  41.33 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.09 
 
 		 543 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  39.33 
 
 		 492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  38.79 
 
 		 496 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  39.78 
 
 		 503 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.52 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  38.79 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  37.69 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  38.84 
 
 		 636 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  43.28 
 
 		 702 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  45.61 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  37.52 
 
 		 515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  44.7 
 
 		 1007 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.62 
 
 		 492 aa  300  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  41.32 
 
 		 485 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  42.57 
 
 		 908 aa  299  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  41.32 
 
 		 485 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  38.22 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  38.55 
 
 		 497 aa  297  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  39.91 
 
 		 497 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  43.72 
 
 		 990 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  41.32 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  43.75 
 
 		 1194 aa  296  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  39.69 
 
 		 497 aa  295  9e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  37.22 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  37.76 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  37.25 
 
 		 487 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  37.76 
 
 		 489 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  41.34 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  43.24 
 
 		 1427 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  43.47 
 
 		 653 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  43.47 
 
 		 653 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  40.5 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  40.64 
 
 		 492 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  38.65 
 
 		 489 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  41.6 
 
 		 1041 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  40.77 
 
 		 485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  40.72 
 
 		 483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  42.2 
 
 		 959 aa  290  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  39.29 
 
 		 499 aa  290  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  42.18 
 
 		 1334 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  39.33 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  40.64 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  40.64 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  38.93 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  35.18 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  40.64 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  38.44 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  39.78 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  39.78 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  39.78 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  39.78 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  39.78 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  39.78 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  39.78 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  39.78 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  43.24 
 
 		 645 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  37.98 
 
 		 495 aa  286  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  36.82 
 
 		 517 aa  286  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  39.55 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  39.55 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  38.51 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  41.69 
 
 		 647 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  39.55 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  39.55 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  39.55 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  40.18 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  40.18 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  39.86 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  43.32 
 
 		 713 aa  284  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  40.18 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  42.07 
 
 		 922 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  40.99 
 
 		 669 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1756  ribonuclease, Rne/Rng family  36.2 
 
 		 1016 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000532878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  37.75 
 
 		 495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  38.7 
 
 		 1012 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  40.45 
 
 		 495 aa  283  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  41.39 
 
 		 485 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  37.03 
 
 		 528 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  38.23 
 
 		 1073 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2241  ribonuclease E  36.07 
 
 		 1061 aa  283  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000115068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01080  fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA-binding protein/RNA degradosome binding protein  36.07 
 
 		 1061 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00444981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  38.69 
 
 		 517 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  42.4 
 
 		 687 aa  283  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1061 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  37.45 
 
 		 528 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  36.07 
 
 		 1061 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000196842  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  36.07 
 
 		 1061 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1463  ribonuclease E  36.07 
 
 		 1061 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00215249  hitchhiker  0.000000103406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  36.07 
 
 		 1061 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  39.37 
 
 		 489 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>