More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0541 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 
515 aa  1063    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  50.89 
 
 
525 aa  528  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  43.75 
 
 
559 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.65 
 
 
564 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  42.3 
 
 
494 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  38.89 
 
 
492 aa  347  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  40.4 
 
 
503 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  38.63 
 
 
497 aa  343  5e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.76 
 
 
496 aa  343  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.76 
 
 
496 aa  343  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  38.43 
 
 
497 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.4 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.4 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.08 
 
 
562 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  40.28 
 
 
503 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.6 
 
 
531 aa  334  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  39.84 
 
 
497 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  38.76 
 
 
537 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  39.29 
 
 
483 aa  330  4e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  41.11 
 
 
507 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  38.92 
 
 
530 aa  326  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  38.03 
 
 
495 aa  326  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  38.35 
 
 
926 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  39.2 
 
 
492 aa  324  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2678  ribonuclease, Rne/Rng family  37.52 
 
 
1091 aa  323  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.174133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  37.95 
 
 
499 aa  323  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  37.21 
 
 
1238 aa  322  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  38.69 
 
 
792 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  39.16 
 
 
571 aa  320  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  39.11 
 
 
484 aa  319  9e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  36.21 
 
 
1132 aa  318  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  40.28 
 
 
503 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  36.21 
 
 
1132 aa  318  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  37.63 
 
 
495 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  40.04 
 
 
485 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  39.32 
 
 
741 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  36.06 
 
 
512 aa  317  4e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  40.04 
 
 
485 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  39.03 
 
 
490 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  40.04 
 
 
485 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  37.93 
 
 
808 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  38.88 
 
 
496 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  38.99 
 
 
485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  37.07 
 
 
490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  37.89 
 
 
1012 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  40.24 
 
 
500 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2244  ribonuclease E  37.04 
 
 
663 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2216  ribonuclease E  37.04 
 
 
663 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  39.2 
 
 
485 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1756  ribonuclease, Rne/Rng family  38.03 
 
 
1016 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000532878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  35.64 
 
 
499 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  37.78 
 
 
919 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  38.78 
 
 
485 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2134  ribonuclease  36.38 
 
 
1070 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  38.28 
 
 
1073 aa  310  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  39.41 
 
 
492 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  38.31 
 
 
806 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  38.64 
 
 
702 aa  309  8e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  38.33 
 
 
493 aa  309  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  39.2 
 
 
485 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  37.75 
 
 
543 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2511  ribonuclease E  38.43 
 
 
1113 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00474333  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  36.86 
 
 
942 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02342  RNase E  36.56 
 
 
1131 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.596666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  40.38 
 
 
411 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1600  ribonuclease E  38.25 
 
 
1048 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000427165  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  37.34 
 
 
483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  37.5 
 
 
1139 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  36.72 
 
 
489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  38.05 
 
 
489 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  38.05 
 
 
489 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  38.05 
 
 
489 aa  307  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  37.68 
 
 
489 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  38.05 
 
 
489 aa  307  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2843  ribonuclease E and G  37.65 
 
 
764 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  37.89 
 
 
489 aa  307  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  37.68 
 
 
489 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  38.05 
 
 
489 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  38.05 
 
 
489 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  35.18 
 
 
528 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3507  ribonuclease E  38.43 
 
 
1216 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0058516  normal  0.0230667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  38.05 
 
 
489 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  37.68 
 
 
489 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  37.68 
 
 
489 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  37.68 
 
 
489 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  38.05 
 
 
489 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  36.65 
 
 
866 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  38.91 
 
 
908 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 
903 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1677  ribonuclease E  38.43 
 
 
1216 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000377607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  36.63 
 
 
688 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  35.92 
 
 
487 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  37.78 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1569  ribonuclease E  38.43 
 
 
1216 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000219809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  38.05 
 
 
1061 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  38.05 
 
 
1061 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000196842  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2042  ribonuclease E  38.05 
 
 
1057 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000184616  hitchhiker  0.00765925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  38.05 
 
 
1061 aa  306  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  37.3 
 
 
1073 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1463  ribonuclease E  38.05 
 
 
1061 aa  306  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00215249  hitchhiker  0.000000103406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>