More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2121 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  100 
 
 		 474 aa  944    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  45.05 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  43.15 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  43.6 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  39.88 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  45.87 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  44.1 
 
 		 702 aa  352  7e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  43.65 
 
 		 497 aa  351  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  44.99 
 
 		 571 aa  350  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  44.82 
 
 		 503 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  45.52 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  45.52 
 
 		 496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  43.51 
 
 		 1427 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  42.73 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  41.42 
 
 		 530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  42.79 
 
 		 531 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  44.53 
 
 		 908 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  38.41 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  37.69 
 
 		 496 aa  336  5e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  43.07 
 
 		 990 aa  336  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  39.82 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  43.46 
 
 		 1007 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  42.53 
 
 		 485 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  42.53 
 
 		 485 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  44.72 
 
 		 1194 aa  332  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  43.95 
 
 		 416 aa  330  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  36.6 
 
 		 543 aa  329  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  38.63 
 
 		 492 aa  329  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  43.53 
 
 		 922 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  41.98 
 
 		 1041 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.63 
 
 		 496 aa  326  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.63 
 
 		 496 aa  326  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  40.9 
 
 		 489 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  42.03 
 
 		 489 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  40.47 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  42.73 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  36.85 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  40.1 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  41.89 
 
 		 483 aa  319  9e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  41.4 
 
 		 485 aa  319  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  40.62 
 
 		 1043 aa  318  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  37.19 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  39.07 
 
 		 476 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  44.87 
 
 		 500 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  38.33 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  37.14 
 
 		 489 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  40.36 
 
 		 485 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  40.58 
 
 		 488 aa  316  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  36.63 
 
 		 497 aa  316  7e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  42.2 
 
 		 1334 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  39.87 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  42.73 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  37.14 
 
 		 489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  42.51 
 
 		 1024 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  37.14 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  42.05 
 
 		 1058 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  41.59 
 
 		 1151 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  40.72 
 
 		 492 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  44.17 
 
 		 507 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  40.83 
 
 		 1117 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  40.27 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  41.85 
 
 		 1113 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  40.73 
 
 		 944 aa  310  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  41.15 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  41.07 
 
 		 484 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  40.27 
 
 		 485 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  38.36 
 
 		 495 aa  309  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  40.18 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  40.27 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  38.98 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  40.75 
 
 		 1265 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  41.03 
 
 		 1093 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  42.04 
 
 		 959 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  36.71 
 
 		 495 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  42.36 
 
 		 952 aa  305  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  41.19 
 
 		 974 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  41.56 
 
 		 1048 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  39.82 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  36.49 
 
 		 495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  39.9 
 
 		 1070 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  37.02 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  41.57 
 
 		 1091 aa  303  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  38.29 
 
 		 485 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  39.82 
 
 		 485 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  41.25 
 
 		 717 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  41.73 
 
 		 487 aa  302  8.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  39.33 
 
 		 489 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  39.33 
 
 		 489 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  39.33 
 
 		 489 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  37.72 
 
 		 515 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  37.39 
 
 		 496 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  36.25 
 
 		 636 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  39.56 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  39.9 
 
 		 1022 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  38.96 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  36.94 
 
 		 517 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  36.84 
 
 		 499 aa  299  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  38.29 
 
 		 486 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  38.12 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  38.12 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>