More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2266 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  70.86 
 
 		 1427 aa  720    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  73.71 
 
 		 1151 aa  733    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  68.62 
 
 		 1080 aa  643    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  68.88 
 
 		 717 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  82.62 
 
 		 1117 aa  907    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  73.15 
 
 		 1091 aa  714    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  57.59 
 
 		 1123 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  73.06 
 
 		 1058 aa  681    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  74.63 
 
 		 1334 aa  736    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  74.38 
 
 		 908 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  69.29 
 
 		 1024 aa  684    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 1043 aa  2033    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  80.49 
 
 		 1018 aa  796    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  82.67 
 
 		 1265 aa  880    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  79.91 
 
 		 952 aa  755    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  72.41 
 
 		 959 aa  673    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  64.75 
 
 		 974 aa  710    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  61.41 
 
 		 1093 aa  650    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  76.34 
 
 		 1041 aa  707    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  82.45 
 
 		 944 aa  810    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  68.01 
 
 		 1040 aa  684    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  64.91 
 
 		 991 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  61.69 
 
 		 961 aa  658    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  75.47 
 
 		 1048 aa  706    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  77.18 
 
 		 1244 aa  684    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  64.88 
 
 		 1113 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  64.91 
 
 		 987 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  74.68 
 
 		 1007 aa  707    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  64.72 
 
 		 1016 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  73.12 
 
 		 702 aa  684    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  73.32 
 
 		 1070 aa  701    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  75.84 
 
 		 990 aa  711    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  64.39 
 
 		 1022 aa  637    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  64.91 
 
 		 991 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  66.53 
 
 		 953 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  48.13 
 
 		 457 aa  405  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  43.57 
 
 		 559 aa  336  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  44.66 
 
 		 562 aa  332  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  44.91 
 
 		 636 aa  320  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  42.69 
 
 		 564 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  41.02 
 
 		 494 aa  316  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  43.88 
 
 		 571 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  42 
 
 		 497 aa  308  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.76 
 
 		 497 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.22 
 
 		 483 aa  301  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  39.95 
 
 		 492 aa  302  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  37.82 
 
 		 503 aa  300  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  41.87 
 
 		 411 aa  297  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.68 
 
 		 497 aa  295  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  44.85 
 
 		 485 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.52 
 
 		 496 aa  294  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.52 
 
 		 496 aa  294  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  44.61 
 
 		 485 aa  294  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.68 
 
 		 492 aa  294  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  37.71 
 
 		 1071 aa  292  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  38.4 
 
 		 1056 aa  292  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  39.9 
 
 		 496 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  38.79 
 
 		 503 aa  290  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  38.41 
 
 		 531 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.9 
 
 		 496 aa  288  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  37.78 
 
 		 938 aa  288  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  36.77 
 
 		 528 aa  287  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.32 
 
 		 543 aa  287  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40.99 
 
 		 489 aa  287  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  36.83 
 
 		 866 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  39.85 
 
 		 491 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  36.88 
 
 		 1073 aa  286  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  40.99 
 
 		 489 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  40.99 
 
 		 489 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  37.5 
 
 		 483 aa  285  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  37.22 
 
 		 926 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0282  ribonuclease  36.93 
 
 		 1449 aa  284  6.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.936888  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  39.6 
 
 		 968 aa  284  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  37.59 
 
 		 1175 aa  284  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  38.08 
 
 		 485 aa  283  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  42.96 
 
 		 416 aa  283  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  40.62 
 
 		 474 aa  283  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0256  RNAse E  36.69 
 
 		 1405 aa  282  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0479  ribonuclease  37.17 
 
 		 1368 aa  282  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  39.76 
 
 		 483 aa  281  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  35.51 
 
 		 528 aa  281  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  39.9 
 
 		 1057 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  37.94 
 
 		 1076 aa  281  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  37.29 
 
 		 1012 aa  281  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  36.24 
 
 		 530 aa  281  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  40.55 
 
 		 490 aa  280  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1573  ribonuclease  35.33 
 
 		 1128 aa  280  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2405  RNAse E  36.78 
 
 		 1093 aa  280  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  44.04 
 
 		 485 aa  280  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.93 
 
 		 1128 aa  280  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2475  RNAse E  36.78 
 
 		 1095 aa  280  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.350754  normal  0.0309861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2567  RNAse E  36.78 
 
 		 1098 aa  280  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  41.53 
 
 		 493 aa  279  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  37.83 
 
 		 515 aa  279  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  39.73 
 
 		 1082 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  37.26 
 
 		 1035 aa  279  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  37 
 
 		 517 aa  279  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  36.69 
 
 		 1120 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  42.22 
 
 		 496 aa  278  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  38.74 
 
 		 495 aa  278  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>