More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2082 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  69.98 
 
 		 489 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2197  ribonuclease G  67.81 
 
 		 489 aa  668    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  69.98 
 
 		 489 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  82.83 
 
 		 495 aa  841    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  70.04 
 
 		 488 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1891  ribonuclease G  69.84 
 
 		 488 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  82.42 
 
 		 495 aa  838    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  64.91 
 
 		 483 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  70.04 
 
 		 488 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2395  ribonuclease, Rne/Rng family  68.69 
 
 		 489 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  68.22 
 
 		 486 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3824  ribonuclease, Rne/Rng family  68.15 
 
 		 484 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1377  ribonuclease G  70.04 
 
 		 488 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  69.98 
 
 		 489 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  69.98 
 
 		 490 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  68.97 
 
 		 489 aa  700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1008  ribonuclease G  69.57 
 
 		 508 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1946  ribonuclease  73.44 
 
 		 493 aa  714    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  75.75 
 
 		 499 aa  784    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  100 
 
 		 491 aa  997    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2622  ribonuclease  81.62 
 
 		 495 aa  822    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134326  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  76.85 
 
 		 501 aa  797    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  69.17 
 
 		 489 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  82.22 
 
 		 517 aa  829    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1995  ribonuclease, Rne/Rng family  68.69 
 
 		 489 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422302  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0778  RNAse G  68.76 
 
 		 510 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  69.98 
 
 		 489 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  69.84 
 
 		 488 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1344  ribonuclease G  72.32 
 
 		 490 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0799  ribonuclease G  69.84 
 
 		 488 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0351  ribonuclease  69.84 
 
 		 488 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  78.3 
 
 		 508 aa  805    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  69.98 
 
 		 489 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  69.98 
 
 		 489 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  81.41 
 
 		 515 aa  826    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  69.57 
 
 		 489 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  64.5 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0611  ribonuclease  61.12 
 
 		 487 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  61.34 
 
 		 483 aa  590  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2112  ribonuclease G  60.73 
 
 		 483 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  56.45 
 
 		 485 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  53.23 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  51.91 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  53.23 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  53.94 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  56.45 
 
 		 485 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  55.85 
 
 		 485 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  55.91 
 
 		 485 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  55.04 
 
 		 492 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  55.91 
 
 		 485 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  55.65 
 
 		 485 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  55.71 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  54.53 
 
 		 490 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  56.82 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  55.85 
 
 		 485 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  54.71 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  54.64 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  54.64 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  54.05 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  51.53 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  52.6 
 
 		 496 aa  498  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  53.02 
 
 		 487 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  53.12 
 
 		 484 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  55.53 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  53.13 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  50.2 
 
 		 490 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  52.31 
 
 		 497 aa  491  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  50.1 
 
 		 487 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  53.86 
 
 		 500 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  52.73 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  50.1 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  52.73 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  52.53 
 
 		 502 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  53.66 
 
 		 500 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  52.31 
 
 		 497 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  53.64 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  52.73 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  51.92 
 
 		 489 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  52.73 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  52.53 
 
 		 489 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  53.46 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  52.59 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  52.73 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  52.73 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  52.73 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  52.73 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  52.32 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  52.32 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  52.32 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  52.73 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  52.73 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  52.32 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  52.73 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  52.53 
 
 		 502 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  52.32 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  51.52 
 
 		 495 aa  488  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  52.53 
 
 		 502 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  52.32 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  52.73 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  52.73 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>