More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1618 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  76.7 
 
 		 1043 aa  816    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  74.2 
 
 		 1427 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  76.2 
 
 		 1117 aa  813    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  71.79 
 
 		 1024 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  72 
 
 		 1058 aa  682    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  65.31 
 
 		 1093 aa  709    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  72.02 
 
 		 1334 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  73.64 
 
 		 908 aa  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  74.43 
 
 		 1048 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  53.31 
 
 		 1093 aa  640    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  71.43 
 
 		 959 aa  671    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  74.89 
 
 		 1007 aa  721    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  62.23 
 
 		 1080 aa  647    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  75.32 
 
 		 1194 aa  721    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  74.2 
 
 		 990 aa  708    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  75.18 
 
 		 1265 aa  836    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  72.36 
 
 		 1091 aa  702    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  69.04 
 
 		 1040 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  61.14 
 
 		 974 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  62.72 
 
 		 991 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  79.87 
 
 		 1018 aa  778    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  62.72 
 
 		 987 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  70.23 
 
 		 1151 aa  737    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  73.02 
 
 		 922 aa  719    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  75.48 
 
 		 1041 aa  711    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  77.14 
 
 		 952 aa  742    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  70.1 
 
 		 1113 aa  740    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  64.96 
 
 		 1016 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  60.39 
 
 		 1123 aa  647    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  67.18 
 
 		 702 aa  690    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  73.46 
 
 		 1244 aa  686    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  73.45 
 
 		 1070 aa  715    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 944 aa  1835    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  62.72 
 
 		 991 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  62.66 
 
 		 961 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  65.32 
 
 		 1022 aa  633  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  69.74 
 
 		 717 aa  635  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  64.53 
 
 		 953 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  46.44 
 
 		 457 aa  399  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  45.07 
 
 		 559 aa  344  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  43.86 
 
 		 562 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  44.44 
 
 		 636 aa  320  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  42.79 
 
 		 564 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  40.38 
 
 		 492 aa  312  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  38.24 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  42.42 
 
 		 497 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  42.05 
 
 		 497 aa  304  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  41.8 
 
 		 571 aa  302  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  39.86 
 
 		 496 aa  300  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  39.86 
 
 		 496 aa  300  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  40.8 
 
 		 411 aa  295  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  38.43 
 
 		 531 aa  295  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  41.2 
 
 		 491 aa  294  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  38.14 
 
 		 543 aa  294  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.26 
 
 		 483 aa  293  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1378  ribonuclease, Rne/Rng family  38.35 
 
 		 1074 aa  293  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.39 
 
 		 503 aa  292  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.09 
 
 		 496 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  40.33 
 
 		 496 aa  290  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.13 
 
 		 503 aa  290  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  40.57 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  43.2 
 
 		 485 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  37.35 
 
 		 483 aa  288  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  40.53 
 
 		 489 aa  288  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  40.53 
 
 		 489 aa  288  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40.29 
 
 		 489 aa  288  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1720  ribonuclease  39.08 
 
 		 1007 aa  287  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  37.74 
 
 		 1056 aa  287  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  40.81 
 
 		 496 aa  287  7e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  42.72 
 
 		 485 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1053 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0282  ribonuclease  36.26 
 
 		 1449 aa  286  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.936888  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  39.43 
 
 		 938 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2643  ribonuclease, Rne/Rng family  38.13 
 
 		 1029 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  40.05 
 
 		 490 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  36.67 
 
 		 1238 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1173  ribonuclease E  38.13 
 
 		 1040 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  39.24 
 
 		 1071 aa  284  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0256  RNAse E  36.02 
 
 		 1405 aa  284  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  37.59 
 
 		 1076 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2275  RNAse E  39.95 
 
 		 1042 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40 
 
 		 492 aa  284  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3290  ribonuclease E  38.13 
 
 		 1025 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  37.38 
 
 		 1059 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  40.2 
 
 		 1057 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  36.9 
 
 		 1132 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0592  ribonuclease  39.16 
 
 		 1058 aa  283  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0452769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1069  ribonuclease  39.18 
 
 		 1056 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17751  decreased coverage  0.00648425 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  42.11 
 
 		 416 aa  283  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  38.93 
 
 		 1175 aa  283  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  35.93 
 
 		 1139 aa  283  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  36.67 
 
 		 1132 aa  282  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1040  ribonuclease E protein  37.38 
 
 		 1014 aa  282  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  37.62 
 
 		 1111 aa  282  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  39.34 
 
 		 499 aa  282  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0631  ribonuclease  39.18 
 
 		 1059 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0577121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1110  ribonuclease  39.18 
 
 		 1059 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  37.92 
 
 		 928 aa  282  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0905  ribonuclease, Rne/Rng family  37.62 
 
 		 1011 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0755598  normal  0.0613595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  43.03 
 
 		 490 aa  281  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>