More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1186 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  73.13 
 
 		 1244 aa  666    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  75.43 
 
 		 1117 aa  717    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  71.94 
 
 		 1024 aa  725    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  83.07 
 
 		 1093 aa  863    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  70.59 
 
 		 1018 aa  672    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  62.83 
 
 		 1123 aa  709    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  66.97 
 
 		 952 aa  717    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  70.27 
 
 		 1080 aa  704    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  71.17 
 
 		 908 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  69.94 
 
 		 1016 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  72.71 
 
 		 1427 aa  765    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  72.13 
 
 		 1058 aa  723    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  71.34 
 
 		 1041 aa  714    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  72.56 
 
 		 1007 aa  710    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  68.75 
 
 		 1265 aa  732    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 974 aa  1918    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  74.23 
 
 		 1194 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  71.67 
 
 		 1048 aa  735    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  72.24 
 
 		 1151 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  58.21 
 
 		 953 aa  693    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  70.79 
 
 		 990 aa  708    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  70.17 
 
 		 922 aa  716    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  67.48 
 
 		 991 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  67.48 
 
 		 991 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  67.48 
 
 		 987 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  56.57 
 
 		 959 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  67.87 
 
 		 717 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  71.87 
 
 		 1334 aa  762    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  67.32 
 
 		 1113 aa  741    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  71.49 
 
 		 944 aa  712    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  71.33 
 
 		 702 aa  674    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  73.94 
 
 		 1070 aa  714    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  66.67 
 
 		 1043 aa  720    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  60.52 
 
 		 1022 aa  569  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  59.91 
 
 		 1093 aa  565  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  49.52 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  43.84 
 
 		 559 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  41.45 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  43.65 
 
 		 564 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  41.45 
 
 		 494 aa  320  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  43.18 
 
 		 636 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  41.39 
 
 		 562 aa  311  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.89 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.07 
 
 		 543 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  41.59 
 
 		 411 aa  307  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  42.11 
 
 		 571 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  42.89 
 
 		 492 aa  302  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.75 
 
 		 497 aa  300  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  41.43 
 
 		 497 aa  299  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  40.5 
 
 		 503 aa  299  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.9 
 
 		 496 aa  298  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.43 
 
 		 497 aa  298  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.9 
 
 		 496 aa  298  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  40 
 
 		 476 aa  297  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  41.49 
 
 		 491 aa  297  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  41.02 
 
 		 490 aa  296  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  41.26 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  38.25 
 
 		 531 aa  292  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  43.03 
 
 		 416 aa  291  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  41.03 
 
 		 496 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  40.28 
 
 		 499 aa  290  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  39.91 
 
 		 495 aa  290  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  38.25 
 
 		 515 aa  290  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  39.95 
 
 		 501 aa  289  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  39.91 
 
 		 495 aa  289  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  43.2 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  41.3 
 
 		 489 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  43.34 
 
 		 490 aa  288  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  43.2 
 
 		 485 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  41.53 
 
 		 517 aa  287  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.69 
 
 		 503 aa  286  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  42.01 
 
 		 489 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  36.8 
 
 		 1175 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  42.01 
 
 		 489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  42.58 
 
 		 487 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  35.88 
 
 		 866 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  36.91 
 
 		 528 aa  283  8.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  37.14 
 
 		 1132 aa  283  9e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  37.2 
 
 		 1082 aa  283  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  41.81 
 
 		 484 aa  282  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  39.62 
 
 		 496 aa  283  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.84 
 
 		 1128 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  38.18 
 
 		 517 aa  281  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  42.72 
 
 		 492 aa  281  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  36.89 
 
 		 1132 aa  281  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  37.44 
 
 		 1057 aa  281  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  36.61 
 
 		 483 aa  280  7e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  38.71 
 
 		 515 aa  280  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  36.6 
 
 		 1120 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  36.93 
 
 		 1056 aa  280  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  35.93 
 
 		 1053 aa  280  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  40.32 
 
 		 500 aa  280  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  41.42 
 
 		 483 aa  279  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  35.93 
 
 		 1059 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  40.21 
 
 		 938 aa  280  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  37.02 
 
 		 530 aa  280  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  38.43 
 
 		 508 aa  279  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  36.71 
 
 		 1012 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  37.44 
 
 		 1073 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  36.98 
 
 		 487 aa  278  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>