More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0770 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 457 aa  916    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  50.72 
 
 		 908 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  50.24 
 
 		 1007 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  47.82 
 
 		 1117 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  48.7 
 
 		 1427 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  49.64 
 
 		 702 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  49.29 
 
 		 922 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  46.36 
 
 		 1265 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  50.61 
 
 		 1194 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  48.13 
 
 		 1043 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  47.07 
 
 		 1093 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  49.76 
 
 		 1041 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  50.72 
 
 		 717 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  47.47 
 
 		 1334 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  45.61 
 
 		 952 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  48.68 
 
 		 990 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  49.52 
 
 		 1058 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  49.39 
 
 		 1040 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  49.88 
 
 		 1048 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  46.75 
 
 		 974 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  49.04 
 
 		 1093 aa  400  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  46.44 
 
 		 944 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  49.3 
 
 		 1070 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  50 
 
 		 1080 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  49.29 
 
 		 1024 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  49.39 
 
 		 1123 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  49.14 
 
 		 1022 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  48.1 
 
 		 959 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  45.1 
 
 		 1018 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  47.48 
 
 		 961 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  43.46 
 
 		 1151 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  47.24 
 
 		 991 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  47.24 
 
 		 987 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  47.27 
 
 		 953 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  47.24 
 
 		 991 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  43.04 
 
 		 1113 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  47.65 
 
 		 1091 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  49.37 
 
 		 1244 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  47.27 
 
 		 1016 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  46.43 
 
 		 636 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  41.37 
 
 		 559 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.27 
 
 		 564 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.82 
 
 		 497 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  42.18 
 
 		 571 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  39.16 
 
 		 494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.89 
 
 		 492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  41.61 
 
 		 562 aa  302  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  39.14 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  40.29 
 
 		 483 aa  299  6e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  40.45 
 
 		 543 aa  299  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  39.05 
 
 		 503 aa  299  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  40.14 
 
 		 530 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  40.33 
 
 		 497 aa  296  8e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  39.55 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  40.09 
 
 		 497 aa  294  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  41.42 
 
 		 499 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  40.61 
 
 		 493 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  37.97 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  38.33 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  38.94 
 
 		 487 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  42.93 
 
 		 493 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  40.33 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  38.77 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  41.3 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.53 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  40.14 
 
 		 499 aa  286  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  38.53 
 
 		 496 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.59 
 
 		 496 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.59 
 
 		 496 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  39.86 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  38.53 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  40 
 
 		 491 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  40.1 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  41.97 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  38.7 
 
 		 488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  43.54 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  42.75 
 
 		 485 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  42.79 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  38.76 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  38.37 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  40.38 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  41.1 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  40.85 
 
 		 488 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  38.57 
 
 		 517 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  36.2 
 
 		 476 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  38.76 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  40.9 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  38.25 
 
 		 500 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  41.95 
 
 		 485 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  40.05 
 
 		 496 aa  279  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  39.63 
 
 		 500 aa  279  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40.79 
 
 		 489 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  39.81 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  39.72 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  38.21 
 
 		 525 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  40.85 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  40.85 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1564  RNAse E  37.91 
 
 		 873 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.270508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  39.14 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  41.1 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>