More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0471 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  86.25 
 
 		 502 aa  872    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  72.69 
 
 		 489 aa  716    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  72.69 
 
 		 489 aa  716    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  87.5 
 
 		 488 aa  859    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  72.69 
 
 		 489 aa  716    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  72.69 
 
 		 489 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  68.03 
 
 		 488 aa  693    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  72.69 
 
 		 489 aa  716    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  73.21 
 
 		 489 aa  727    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  72.9 
 
 		 489 aa  716    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  86.06 
 
 		 502 aa  868    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  65.24 
 
 		 485 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  84.57 
 
 		 500 aa  842    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  88.32 
 
 		 488 aa  870    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  86.25 
 
 		 502 aa  868    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  719    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  72.69 
 
 		 489 aa  716    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  74.03 
 
 		 489 aa  728    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  84.69 
 
 		 500 aa  835    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  84.69 
 
 		 502 aa  842    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  83.64 
 
 		 496 aa  834    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  715    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  87.5 
 
 		 488 aa  859    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  67.83 
 
 		 487 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  67.97 
 
 		 491 aa  659    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  73.72 
 
 		 489 aa  728    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  87.05 
 
 		 502 aa  876    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  88.52 
 
 		 488 aa  870    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  85.37 
 
 		 500 aa  847    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3734  ribonuclease G  85.8 
 
 		 496 aa  852    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  72.69 
 
 		 489 aa  716    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  73.82 
 
 		 489 aa  729    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  72.69 
 
 		 489 aa  716    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  87.05 
 
 		 502 aa  876    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  73.72 
 
 		 489 aa  724    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  72.48 
 
 		 489 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  100 
 
 		 502 aa  1031    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  71.98 
 
 		 489 aa  701    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  70.08 
 
 		 491 aa  676    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  71.87 
 
 		 489 aa  706    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  73.31 
 
 		 489 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  57.4 
 
 		 493 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  57.49 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  57.4 
 
 		 492 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  57.86 
 
 		 495 aa  548  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  57.29 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  57.49 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  58.13 
 
 		 493 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  56.68 
 
 		 485 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  54.27 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  56.68 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  56.88 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  57.09 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  54.03 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  54.03 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  53.46 
 
 		 492 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  54.88 
 
 		 492 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  57.6 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  54.07 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  54.07 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  57.09 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  53.07 
 
 		 483 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  56.28 
 
 		 485 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  57.03 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  55.22 
 
 		 497 aa  531  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  56.88 
 
 		 485 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  53.51 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  55.02 
 
 		 497 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  56.57 
 
 		 504 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  55.6 
 
 		 484 aa  528  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  57.17 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  54.18 
 
 		 490 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  52.1 
 
 		 501 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  54.27 
 
 		 489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  51.77 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  52.54 
 
 		 495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  54.47 
 
 		 489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  54.47 
 
 		 490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  52.74 
 
 		 495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  54.31 
 
 		 496 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  54.27 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  53.46 
 
 		 491 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  54.47 
 
 		 489 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  54.27 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  54.27 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1891  ribonuclease G  53.66 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1377  ribonuclease G  53.66 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  53.66 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0799  ribonuclease G  53.66 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1008  ribonuclease G  53.19 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  53.66 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  53.66 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0351  ribonuclease  53.66 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2112  ribonuclease G  55.19 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>