More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0193 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  100 
 
 		 512 aa  1054    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  38.21 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  40.12 
 
 		 503 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  38.16 
 
 		 530 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  36.98 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  39.66 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  37.03 
 
 		 531 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.09 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  39.07 
 
 		 497 aa  330  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  38.43 
 
 		 492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  38.85 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  35.96 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  38.05 
 
 		 483 aa  326  8.000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  37.28 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  34.63 
 
 		 543 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  37.62 
 
 		 500 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  36.54 
 
 		 494 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  36.63 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2678  ribonuclease, Rne/Rng family  37.97 
 
 		 1091 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.174133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  36.63 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  36.74 
 
 		 1012 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  38.02 
 
 		 1132 aa  317  4e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  36.06 
 
 		 515 aa  317  4e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  38.02 
 
 		 1132 aa  316  7e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  36.85 
 
 		 1073 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  36.85 
 
 		 1057 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  38.79 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2244  ribonuclease E  37.84 
 
 		 663 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  36.87 
 
 		 496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2216  ribonuclease E  37.84 
 
 		 663 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  38.6 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  37.18 
 
 		 1238 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  37.92 
 
 		 489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  38.86 
 
 		 938 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  37.47 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  37.7 
 
 		 489 aa  309  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  36.18 
 
 		 1139 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  35.44 
 
 		 487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.38 
 
 		 1128 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  36.58 
 
 		 1120 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  38.28 
 
 		 503 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  36.18 
 
 		 1091 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  38.22 
 
 		 495 aa  306  7e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  36.18 
 
 		 1090 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  36.18 
 
 		 1086 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  36.38 
 
 		 1082 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  35.98 
 
 		 1072 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0282  ribonuclease  37.45 
 
 		 1449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.936888  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  36.33 
 
 		 488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  38.92 
 
 		 1175 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0256  RNAse E  37.23 
 
 		 1405 aa  302  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  38.51 
 
 		 507 aa  302  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  34.99 
 
 		 564 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  35.07 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  39.46 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  35.43 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  33.07 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  35.44 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  35.44 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  35.44 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  35.44 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  35.44 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  35.44 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  35.44 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  35.44 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  36.17 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  35.03 
 
 		 517 aa  300  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  37.47 
 
 		 482 aa  299  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  40.13 
 
 		 493 aa  299  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  35.29 
 
 		 1035 aa  299  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  32.39 
 
 		 551 aa  299  9e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  37.07 
 
 		 499 aa  299  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  35.57 
 
 		 688 aa  299  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  36.51 
 
 		 571 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1874  ribonuclease, Rne/Rng family  34.87 
 
 		 782 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000717737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  35.23 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  35.23 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  35.23 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1707  ribonuclease E  39.09 
 
 		 1068 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000337375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  35.23 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  36.69 
 
 		 489 aa  299  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2112  ribonuclease G  38.56 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  35.23 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2220  ribonuclease, Rne/Rng family  34.87 
 
 		 782 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0595  ribonuclease  37.18 
 
 		 718 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000095022  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  35.21 
 
 		 1024 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1590  ribonuclease E  37.18 
 
 		 720 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000584784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  32.3 
 
 		 565 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  36.54 
 
 		 1015 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  37.82 
 
 		 1073 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  39.32 
 
 		 1071 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  36.08 
 
 		 495 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  36.08 
 
 		 495 aa  297  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  36.29 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  35.71 
 
 		 1111 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1353  ribonuclease E  36.44 
 
 		 938 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000765938  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0389  ribonuclease  34.87 
 
 		 879 aa  296  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.57215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  31.62 
 
 		 562 aa  296  6e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  38.86 
 
 		 1087 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  38.86 
 
 		 1087 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>