More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16241 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  61.72 
 
 		 640 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  67.94 
 
 		 646 aa  749    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  68.27 
 
 		 646 aa  771    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  54.8 
 
 		 605 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  54.63 
 
 		 602 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  57.24 
 
 		 608 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  61.15 
 
 		 640 aa  704    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  54 
 
 		 606 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  100 
 
 		 624 aa  1253    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  67.27 
 
 		 647 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  65.22 
 
 		 687 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  58.02 
 
 		 669 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  64.81 
 
 		 808 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  64.49 
 
 		 713 aa  577  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  51.05 
 
 		 645 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  62.47 
 
 		 653 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  62.56 
 
 		 682 aa  565  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  62.47 
 
 		 653 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  40.39 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  40.15 
 
 		 411 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  41.82 
 
 		 564 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  40.15 
 
 		 908 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  40.16 
 
 		 702 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  39.4 
 
 		 1007 aa  279  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  40.97 
 
 		 990 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  35.19 
 
 		 496 aa  276  9e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  36.31 
 
 		 1041 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  39.79 
 
 		 1058 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  39.79 
 
 		 1024 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  40.16 
 
 		 1093 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  36.95 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  35.59 
 
 		 562 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  38.78 
 
 		 952 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  38.54 
 
 		 1194 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  39.73 
 
 		 1427 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  35.01 
 
 		 483 aa  270  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  38.01 
 
 		 922 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  43.28 
 
 		 416 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  39.73 
 
 		 974 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  39.8 
 
 		 1334 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  40.42 
 
 		 1043 aa  266  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  39.69 
 
 		 1123 aa  266  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  39.95 
 
 		 1093 aa  266  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  36.91 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  39.31 
 
 		 959 aa  264  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  36.15 
 
 		 476 aa  264  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  40.6 
 
 		 571 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  39.26 
 
 		 1265 aa  261  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  37.5 
 
 		 717 aa  260  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  38.89 
 
 		 1022 aa  260  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  38.6 
 
 		 1080 aa  259  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  39.42 
 
 		 1048 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  39.79 
 
 		 1070 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  39.52 
 
 		 1040 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  34.63 
 
 		 515 aa  256  7e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  38.26 
 
 		 1117 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  35.84 
 
 		 512 aa  253  7e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  38.63 
 
 		 944 aa  253  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1615  ribonuclease, Rne/Rng family  37.87 
 
 		 1058 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000319313  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  36.99 
 
 		 496 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  36.99 
 
 		 496 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  39.47 
 
 		 1151 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  39.73 
 
 		 1113 aa  253  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.77 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  37.04 
 
 		 636 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2511  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1113 aa  251  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00474333  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  38.32 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1490  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.57 
 
 		 1124 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.326409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  37.62 
 
 		 1122 aa  251  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2816  ribonuclease E  37.62 
 
 		 1121 aa  250  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00267025  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1579  ribonuclease, Rne/Rng family  37.06 
 
 		 1060 aa  250  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00521114  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1677  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1216 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000377607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3507  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1216 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0058516  normal  0.0230667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  38.16 
 
 		 1091 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1569  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1216 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000219809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  36.57 
 
 		 1068 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 		 1244 aa  247  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  35.71 
 
 		 520 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  36.57 
 
 		 1067 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  36.32 
 
 		 1084 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  36.57 
 
 		 1067 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  36.57 
 
 		 1067 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1282  ribonuclease E  36.57 
 
 		 1068 aa  247  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783205  hitchhiker  0.0000048225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  35.68 
 
 		 492 aa  246  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  36.32 
 
 		 1141 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38.31 
 
 		 1128 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  38.63 
 
 		 1018 aa  246  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  38.04 
 
 		 489 aa  246  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  37.16 
 
 		 942 aa  246  9e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  38.56 
 
 		 1120 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  37.5 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  35.82 
 
 		 1102 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  38.06 
 
 		 1057 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1600  ribonuclease E  36.57 
 
 		 1048 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  34.87 
 
 		 525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  38.06 
 
 		 1073 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  36.32 
 
 		 1061 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1061 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1207  ribonuclease E  36.32 
 
 		 1061 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2042  ribonuclease E  36.32 
 
 		 1057 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000184616  hitchhiker  0.00765925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>