More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4433 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 520 aa  1065    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  65.31 
 
 		 535 aa  720    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  59.5 
 
 		 516 aa  647    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  77.52 
 
 		 520 aa  851    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  58.57 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  52.83 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  53.01 
 
 		 543 aa  551  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  53.61 
 
 		 514 aa  546  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  52.32 
 
 		 516 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  48.71 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  39.34 
 
 		 565 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  37.93 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  38.12 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  40.23 
 
 		 551 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  37.84 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  38.73 
 
 		 566 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  40.64 
 
 		 604 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  42.57 
 
 		 570 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  34.66 
 
 		 525 aa  303  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  35.11 
 
 		 503 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.98 
 
 		 503 aa  293  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  37.19 
 
 		 515 aa  292  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  37.55 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  37.12 
 
 		 496 aa  289  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  38.27 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  33.83 
 
 		 494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  36.27 
 
 		 531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  35.53 
 
 		 564 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  34.69 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  33.26 
 
 		 512 aa  279  9e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  36.91 
 
 		 500 aa  276  9e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  34.53 
 
 		 636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  35.99 
 
 		 792 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  35.07 
 
 		 562 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  37.47 
 
 		 507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  32.7 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  35.52 
 
 		 866 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  33.56 
 
 		 489 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  35.62 
 
 		 741 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  30.6 
 
 		 543 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  34.55 
 
 		 496 aa  270  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  34.55 
 
 		 496 aa  270  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  33.94 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  33.94 
 
 		 489 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  36.34 
 
 		 919 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  36.87 
 
 		 942 aa  268  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  32.98 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  36.32 
 
 		 1024 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  36.53 
 
 		 926 aa  267  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  36.64 
 
 		 688 aa  266  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  33.86 
 
 		 492 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  36.43 
 
 		 903 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  35 
 
 		 497 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  36.7 
 
 		 1139 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  32.41 
 
 		 496 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  36.09 
 
 		 1035 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  35.84 
 
 		 806 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  36.78 
 
 		 1056 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  35.84 
 
 		 1015 aa  264  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  35.1 
 
 		 537 aa  263  4e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  33.87 
 
 		 501 aa  264  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  34.25 
 
 		 808 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  35.6 
 
 		 1070 aa  263  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  33.63 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  35.86 
 
 		 1012 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  34.3 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  35.61 
 
 		 908 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0321  ribonuclease  34.99 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.691253  normal  0.292271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.73 
 
 		 1128 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2843  ribonuclease E and G  35.63 
 
 		 764 aa  261  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  36.51 
 
 		 1082 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  33.86 
 
 		 495 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  34.51 
 
 		 702 aa  261  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  33.63 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  35.44 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  32.25 
 
 		 530 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  34.7 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  36.51 
 
 		 1120 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  36.49 
 
 		 1076 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  32.81 
 
 		 492 aa  259  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  33.64 
 
 		 487 aa  259  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  37.22 
 
 		 713 aa  259  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  33.49 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  35.59 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  33.54 
 
 		 687 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  34.75 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  34.52 
 
 		 990 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  36.28 
 
 		 1073 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  36.28 
 
 		 1086 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2134  ribonuclease  35.47 
 
 		 1070 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  36.28 
 
 		 1091 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  36.28 
 
 		 1072 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  36.28 
 
 		 1090 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  34.17 
 
 		 489 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  36.28 
 
 		 1057 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  34.7 
 
 		 489 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  34.88 
 
 		 491 aa  256  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  36.38 
 
 		 1071 aa  256  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  34.7 
 
 		 489 aa  256  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  34.98 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>