More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16921 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  57.88 
 
 		 640 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  57.85 
 
 		 640 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  55.88 
 
 		 646 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  100 
 
 		 602 aa  1214    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  55.58 
 
 		 646 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  62.93 
 
 		 624 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  84.63 
 
 		 605 aa  999    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  69.74 
 
 		 608 aa  822    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  87.95 
 
 		 606 aa  1056    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  54.12 
 
 		 647 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  53.61 
 
 		 713 aa  558  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  54.6 
 
 		 687 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  61.8 
 
 		 808 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  62.5 
 
 		 669 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  49.82 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  61.33 
 
 		 682 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  49.82 
 
 		 653 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  49.82 
 
 		 653 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  38.75 
 
 		 559 aa  293  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  38.89 
 
 		 564 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  38.52 
 
 		 702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  37.22 
 
 		 411 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  36.89 
 
 		 562 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  37.66 
 
 		 908 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  37.16 
 
 		 1007 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  35.07 
 
 		 543 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  40.96 
 
 		 416 aa  262  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  38.9 
 
 		 952 aa  262  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  36.23 
 
 		 494 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  35.14 
 
 		 476 aa  261  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  35.48 
 
 		 496 aa  259  7e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  37.97 
 
 		 1427 aa  257  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  38.83 
 
 		 959 aa  257  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  38.83 
 
 		 1093 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  37.09 
 
 		 1041 aa  256  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  36.1 
 
 		 483 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  37.83 
 
 		 1194 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  35.53 
 
 		 1022 aa  254  3e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  38.36 
 
 		 974 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  41.21 
 
 		 1070 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  37.2 
 
 		 990 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  34.74 
 
 		 1093 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  37.17 
 
 		 922 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  38.24 
 
 		 1123 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  37.1 
 
 		 1151 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  35.09 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  38.31 
 
 		 1048 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  35.32 
 
 		 520 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  36.36 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  37.97 
 
 		 1080 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  39.52 
 
 		 1040 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  34.12 
 
 		 496 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  35.9 
 
 		 717 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  34.12 
 
 		 496 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  34.21 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  33.96 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  36.9 
 
 		 1265 aa  248  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  36.84 
 
 		 571 aa  248  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  36.57 
 
 		 1334 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  33.97 
 
 		 489 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  37.93 
 
 		 1113 aa  247  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  35.94 
 
 		 503 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  34.8 
 
 		 487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  36.84 
 
 		 944 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  35.57 
 
 		 535 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  35.08 
 
 		 636 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  33.18 
 
 		 492 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  35.99 
 
 		 512 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  35.5 
 
 		 531 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  36.3 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  34.35 
 
 		 497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  33.26 
 
 		 528 aa  241  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  37.71 
 
 		 482 aa  240  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.3 
 
 		 496 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  34.33 
 
 		 515 aa  240  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  35.25 
 
 		 1117 aa  240  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  36.32 
 
 		 1043 aa  240  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  33.04 
 
 		 528 aa  239  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  33.56 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  35.7 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  32.22 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  34.18 
 
 		 497 aa  238  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  35.02 
 
 		 503 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  35.36 
 
 		 1058 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  35.36 
 
 		 1024 aa  236  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  36.41 
 
 		 465 aa  236  8e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  38.14 
 
 		 493 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  36.67 
 
 		 987 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  36.67 
 
 		 991 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  29.94 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  36.67 
 
 		 991 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  36.7 
 
 		 961 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  36.48 
 
 		 1016 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  36.99 
 
 		 953 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  36.6 
 
 		 496 aa  233  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  33.82 
 
 		 504 aa  233  7.000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  36.61 
 
 		 1244 aa  233  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  34.89 
 
 		 515 aa  233  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  34.4 
 
 		 516 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  33.04 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>