More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3689 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  59.88 
 
 		 516 aa  646    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  62.98 
 
 		 520 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  100 
 
 		 535 aa  1094    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  65.31 
 
 		 520 aa  720    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  54.65 
 
 		 516 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  53.29 
 
 		 516 aa  537  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  52.12 
 
 		 516 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  50.78 
 
 		 543 aa  518  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  51.57 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  50.3 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  38.64 
 
 		 565 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  39.18 
 
 		 562 aa  369  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  38.74 
 
 		 568 aa  364  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  37.87 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  40.57 
 
 		 551 aa  360  3e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  38.21 
 
 		 566 aa  346  6e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  39.15 
 
 		 570 aa  346  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  42.12 
 
 		 604 aa  316  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  34.24 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  34.17 
 
 		 525 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  36.5 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  36.97 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  35.51 
 
 		 515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  37.1 
 
 		 531 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.39 
 
 		 503 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.54 
 
 		 496 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  32.55 
 
 		 483 aa  280  7e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  34.68 
 
 		 562 aa  279  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  31.99 
 
 		 543 aa  276  9e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  34.18 
 
 		 564 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  35.76 
 
 		 499 aa  273  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  33.12 
 
 		 559 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  33.96 
 
 		 512 aa  269  8e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  36.02 
 
 		 792 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  36.67 
 
 		 500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  32.95 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  32.95 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  33 
 
 		 636 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  32.27 
 
 		 489 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  35.25 
 
 		 487 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  33.63 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  33.63 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  37.04 
 
 		 919 aa  260  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  35.05 
 
 		 571 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  33.33 
 
 		 483 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  35.38 
 
 		 990 aa  259  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  36.89 
 
 		 903 aa  259  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  34.34 
 
 		 866 aa  259  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  31.07 
 
 		 495 aa  259  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  34.68 
 
 		 808 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  35.41 
 
 		 741 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  30.77 
 
 		 491 aa  259  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  33.33 
 
 		 492 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  32.45 
 
 		 537 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  35.73 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  33.55 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  30.68 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  31.86 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  35.6 
 
 		 1007 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  35.38 
 
 		 508 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  33.4 
 
 		 530 aa  256  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  31.8 
 
 		 501 aa  256  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  34.83 
 
 		 1022 aa  256  9e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2843  ribonuclease E and G  36.24 
 
 		 764 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  35.63 
 
 		 908 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  34.45 
 
 		 497 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  35.39 
 
 		 1265 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  36.08 
 
 		 1427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  36.3 
 
 		 1244 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  35.39 
 
 		 702 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  33.12 
 
 		 489 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  32.36 
 
 		 499 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  34.4 
 
 		 926 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  32.5 
 
 		 497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  35.25 
 
 		 489 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  35 
 
 		 490 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  34.63 
 
 		 489 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  35.2 
 
 		 1093 aa  253  9.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  35.05 
 
 		 959 aa  253  9.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  35.8 
 
 		 922 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  32.77 
 
 		 515 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  35.43 
 
 		 1334 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  32.29 
 
 		 497 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  35.25 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  33.56 
 
 		 517 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  34.56 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  36.32 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  32.03 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  35.45 
 
 		 1194 aa  250  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  32.6 
 
 		 496 aa  250  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  35.12 
 
 		 1070 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  35.22 
 
 		 1117 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  33.95 
 
 		 806 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  35.57 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  33.8 
 
 		 1058 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  34.54 
 
 		 974 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  34.99 
 
 		 1041 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  34.67 
 
 		 717 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  35.7 
 
 		 952 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  35.07 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>