More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0313 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  55.58 
 
 		 602 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  64.37 
 
 		 640 aa  733    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  64.54 
 
 		 624 aa  785    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2029  ribonuclease E and G  79.41 
 
 		 646 aa  935    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0313  RNAse E  100 
 
 		 646 aa  1280    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  54.09 
 
 		 608 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  74.09 
 
 		 647 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  60.38 
 
 		 640 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  52.99 
 
 		 606 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  55.43 
 
 		 605 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  55.54 
 
 		 682 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  70.15 
 
 		 687 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  69.42 
 
 		 669 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  69.17 
 
 		 713 aa  607  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  68.96 
 
 		 653 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  68.96 
 
 		 653 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  54.21 
 
 		 645 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  39.95 
 
 		 559 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  40.34 
 
 		 564 aa  293  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  39.9 
 
 		 411 aa  290  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  42.59 
 
 		 702 aa  289  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.13 
 
 		 562 aa  286  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.47 
 
 		 494 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  36.83 
 
 		 476 aa  281  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  41.46 
 
 		 1007 aa  280  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.75 
 
 		 543 aa  279  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  41.13 
 
 		 908 aa  279  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  40.15 
 
 		 1041 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  40.41 
 
 		 990 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  40.96 
 
 		 496 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  40.53 
 
 		 571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  40.76 
 
 		 636 aa  270  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  39.08 
 
 		 1123 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  39.14 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  40.43 
 
 		 1093 aa  267  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  39 
 
 		 1024 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  40.31 
 
 		 1427 aa  266  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  43.43 
 
 		 416 aa  266  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  39.66 
 
 		 717 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  39.8 
 
 		 1194 aa  265  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  39.43 
 
 		 922 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  39.23 
 
 		 1058 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  40.25 
 
 		 1080 aa  264  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  40.3 
 
 		 1334 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  40.96 
 
 		 959 aa  263  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  39.26 
 
 		 952 aa  262  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  38.93 
 
 		 1113 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  38.93 
 
 		 1151 aa  260  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  37.39 
 
 		 1265 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  38.6 
 
 		 503 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  39.73 
 
 		 974 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  38.16 
 
 		 1093 aa  256  6e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  37.63 
 
 		 1022 aa  256  7e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  40.89 
 
 		 1048 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  35.92 
 
 		 483 aa  256  7e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  39.01 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  38.73 
 
 		 1040 aa  256  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.01 
 
 		 496 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  38.52 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  38.82 
 
 		 492 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  39.89 
 
 		 1117 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  38.31 
 
 		 497 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  36.39 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  39.11 
 
 		 1043 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  38.18 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  38.18 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  40 
 
 		 1070 aa  251  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1122 aa  250  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  38.31 
 
 		 489 aa  250  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  38.37 
 
 		 1072 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  38.19 
 
 		 1091 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2511  ribonuclease E  37.22 
 
 		 1113 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00474333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1615  ribonuclease, Rne/Rng family  37.13 
 
 		 1058 aa  249  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000319313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  37.81 
 
 		 1128 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  37.62 
 
 		 1082 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  38.61 
 
 		 1086 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  38.61 
 
 		 1012 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  38.61 
 
 		 1091 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  38.61 
 
 		 1090 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  38.06 
 
 		 1120 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  37.67 
 
 		 503 aa  247  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  37.87 
 
 		 1073 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  35.99 
 
 		 515 aa  247  6e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  38.37 
 
 		 1139 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  38.22 
 
 		 489 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  39.4 
 
 		 1057 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1579  ribonuclease, Rne/Rng family  36.88 
 
 		 1060 aa  246  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00521114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  39.53 
 
 		 493 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  38.42 
 
 		 944 aa  246  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1067 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1067 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3507  ribonuclease E  37.13 
 
 		 1216 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0058516  normal  0.0230667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1569  ribonuclease E  37.13 
 
 		 1216 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000219809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1067 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1677  ribonuclease E  37.13 
 
 		 1216 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000377607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  39.21 
 
 		 1073 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1068 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1490  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.63 
 
 		 1124 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.326409  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1282  ribonuclease E  37.38 
 
 		 1068 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783205  hitchhiker  0.0000048225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.06 
 
 		 489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>