More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0780 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  48.26 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  45.19 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  43.2 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  38.05 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  41.74 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  44.61 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  38.28 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  43.27 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  40.19 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  35.38 
 
 		 244 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  35.24 
 
 		 277 aa  134  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  35.53 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  37.31 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  37.13 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  32.18 
 
 		 208 aa  94.7  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  30.6 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  31.7 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  33.33 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  31.95 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  31.87 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  31.67 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  30.39 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  32 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  33.66 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  29.67 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  34.86 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  29.31 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  29.31 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17051  ribonuclease HII  32.14 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.492555  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  31.87 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  28.5 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  29.61 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  32.34 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  32.85 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  31.25 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  32.52 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  31.88 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  27.78 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  32.7 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  31.03 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  28.92 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  30.1 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  34.08 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  32.91 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  28.91 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  32.18 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  32.24 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  30.64 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1594  ribonuclease HII  32.74 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  30.06 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  32.3 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  33.95 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  30.38 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  30.3 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  30.43 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  31.61 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  28.16 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  31.25 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  31.68 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16931  ribonuclease HII  31.58 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  29.56 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  30.3 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  27.84 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  26.79 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  28.99 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  33.12 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  33.54 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  28.64 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  30.82 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  29.31 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  29.89 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  31.06 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  31.06 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  23 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  30.82 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  28.85 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16251  ribonuclease HII  28.03 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  23.72 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  29.81 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  30.63 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  33.15 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  29.63 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1505  ribonuclease H  26.64 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  31.06 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  32.72 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  29.56 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>