More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0204 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  95.4 
 
 		 239 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  94.14 
 
 		 239 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  70.49 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  57.68 
 
 		 277 aa  255  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  44.29 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  46.51 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  42.01 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  43.95 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  39.82 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  39.63 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 205 aa  158  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  38.76 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  39.02 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  40.18 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  34.72 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  40.28 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  37.67 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  34.35 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  35.4 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  40.3 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  31.8 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  39.9 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  39.22 
 
 		 198 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  39.37 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  38.1 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  34.16 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  32.07 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  34.17 
 
 		 347 aa  98.6  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  35.93 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  32.06 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  32.37 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  32.37 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  31.03 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  29.63 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  36.26 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  31.31 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  29.55 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  30.11 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  30.49 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  37.29 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  32.84 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  32.84 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  30.84 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  33.64 
 
 		 253 aa  72  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  33.14 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  35.15 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  31.07 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  29.17 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  28.11 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  28.64 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  36.26 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  31.73 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  31.73 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  32.78 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  31.73 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  30.09 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  27.88 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  31.49 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  31.82 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  29.75 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  30.95 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  34.55 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  31.36 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  31.16 
 
 		 183 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  33.7 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  26.32 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16821  ribonuclease HII  31.31 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  34.3 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  29.17 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  30.17 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  30.92 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  33.15 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  27.87 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  30.09 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  32.86 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  32.86 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1505  ribonuclease H  27.31 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  28.9 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  31.11 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  29.28 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  26.42 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  30.73 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  26.42 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  31.31 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  30.39 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  31.49 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  32.22 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  29.09 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  30.14 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  29.09 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  33.67 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  30.65 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  29.7 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  29.72 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  28.5 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  31.14 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  32.78 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>