More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0334 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  59.49 
 
 		 197 aa  223  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  57.53 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  57.07 
 
 		 256 aa  180  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  52.78 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 230 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  50 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  51.27 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  51.27 
 
 		 255 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  49.23 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  48.35 
 
 		 269 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 254 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  45.31 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  45.77 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  48.72 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  45.83 
 
 		 213 aa  150  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.08 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.89 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7887  predicted protein  51.91 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.186877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  45.3 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.5 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 299 aa  148  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.9 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  42.33 
 
 		 263 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 257 aa  148  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  47 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 257 aa  147  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 250 aa  147  9e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  52.22 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  46.96 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2098  ribonuclease H  40.27 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0455436  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 279 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 253 aa  145  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.78 
 
 		 277 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 272 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  44.44 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  44.51 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  46.37 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 201 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  43.48 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  43.3 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  42.22 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  43.89 
 
 		 207 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 268 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  44.27 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2303  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000380421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  40.53 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  45.03 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6711  predicted protein  41.4 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00445618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  44.13 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  45 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  43.41 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  46.11 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>