More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0554 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  54.11 
 
 		 268 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  55.81 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  58.46 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  54 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  54 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  53.81 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  54.68 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 208 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  61.54 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  49.76 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  51.03 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  55.94 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  55.45 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  60.66 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  60.66 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  58.01 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  57.07 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  50 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  59.78 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  52.11 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  58.7 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  50.76 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 242 aa  191  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  53.2 
 
 		 229 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  59.02 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  57.98 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  52.71 
 
 		 208 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  55.56 
 
 		 279 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  56.1 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  56.35 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  59.89 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  48.76 
 
 		 257 aa  187  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  53.17 
 
 		 229 aa  187  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  53.72 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  54.26 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  55.85 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  54.89 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  51 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  52.69 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  56.06 
 
 		 260 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  53.14 
 
 		 283 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  51.49 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  52.66 
 
 		 283 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  58.01 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  57.07 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  54.73 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  55.9 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  52.17 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  50.49 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  55.61 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  53.33 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  49.01 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  53.17 
 
 		 209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  55.45 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  56.35 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  55.38 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  54.79 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  52.04 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  55.74 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  51.65 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  55.74 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  51.47 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  54.35 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  53.8 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  52.78 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  59.02 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  52.13 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  53.89 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  48.51 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  52.91 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  49.05 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  48.02 
 
 		 255 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  52.66 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  46.5 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  55.5 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  51.69 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  52.74 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  54.55 
 
 		 238 aa  175  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  55.5 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  47.52 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  54.55 
 
 		 238 aa  175  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  52.76 
 
 		 202 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>