More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2218 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  62.2 
 
 		 216 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  58.49 
 
 		 230 aa  247  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  58.45 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  62.68 
 
 		 217 aa  237  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  62.05 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  58.49 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  54.5 
 
 		 214 aa  201  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  56.48 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  52.31 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  53.68 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  53.89 
 
 		 197 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  51.87 
 
 		 254 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  55.15 
 
 		 260 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  51.38 
 
 		 203 aa  191  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.21 
 
 		 277 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  55.84 
 
 		 206 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  48.72 
 
 		 308 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  51.47 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  50.24 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  54.74 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  55.33 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  53.93 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  51.56 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  43.88 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  51.03 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  48.24 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  54.86 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 253 aa  179  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.59 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 207 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  47.32 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  53.12 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  46.35 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  50 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  47.57 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  54.12 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  54.12 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  50.56 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  48.1 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  48.51 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 283 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  51.81 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 256 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  53.98 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  52.84 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  52.84 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  51.56 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  47.54 
 
 		 193 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  51.14 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  46.32 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  47.72 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  48.77 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  49.48 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  50.49 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  52.84 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>