More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2456 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  100 
 
 
208 aa  421  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  60.68 
 
 
219 aa  245  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  62.68 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  60.7 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  62.68 
 
 
230 aa  227  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  56.61 
 
 
256 aa  227  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  64.62 
 
 
213 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  60.58 
 
 
217 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  53.3 
 
 
277 aa  211  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  49.74 
 
 
242 aa  208  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  52.55 
 
 
257 aa  208  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  52.71 
 
 
214 aa  207  7e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  51.53 
 
 
257 aa  205  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  54.75 
 
 
254 aa  204  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  52.31 
 
 
268 aa  201  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  52.66 
 
 
255 aa  201  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  56.48 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  55 
 
 
198 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  50.48 
 
 
253 aa  198  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  51.24 
 
 
210 aa  198  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  51.27 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  55.94 
 
 
260 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  53.8 
 
 
211 aa  195  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  49.76 
 
 
217 aa  194  6e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.15 
 
 
206 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  52.97 
 
 
308 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  55.1 
 
 
233 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  55.1 
 
 
233 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  48.44 
 
 
253 aa  192  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  55.25 
 
 
201 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  52.97 
 
 
206 aa  191  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.23 
 
 
218 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  54.87 
 
 
260 aa  191  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  53.57 
 
 
257 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  54.14 
 
 
201 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.06 
 
 
202 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.06 
 
 
202 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  51.63 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  53.06 
 
 
257 aa  188  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  53.06 
 
 
257 aa  188  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  53.06 
 
 
257 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  53.06 
 
 
257 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  55 
 
 
201 aa  188  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  53.06 
 
 
257 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  50.54 
 
 
207 aa  187  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  53.89 
 
 
208 aa  187  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  53.59 
 
 
207 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  52.55 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  54.14 
 
 
208 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  52.55 
 
 
257 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  55 
 
 
235 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  55.44 
 
 
227 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  45.6 
 
 
255 aa  184  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  53.63 
 
 
197 aa  184  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  53.04 
 
 
207 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  53.04 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.49 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  52.49 
 
 
218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50.28 
 
 
213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.96 
 
 
250 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  53.04 
 
 
198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  51.93 
 
 
198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  53.04 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  51.93 
 
 
198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  50 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  52.49 
 
 
214 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.53 
 
 
259 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.93 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  53.33 
 
 
240 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  51.38 
 
 
198 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  51.38 
 
 
198 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  51.38 
 
 
198 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  51.65 
 
 
198 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  49.18 
 
 
204 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  46 
 
 
256 aa  179  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  51.67 
 
 
198 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  55.21 
 
 
208 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  52.51 
 
 
203 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  53.89 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  53.89 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  52.2 
 
 
198 aa  178  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  50.75 
 
 
210 aa  178  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  50.28 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  50.26 
 
 
229 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  50.28 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  51.11 
 
 
199 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  51.11 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  50.28 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  52.28 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  48.96 
 
 
208 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  52.17 
 
 
202 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  50.55 
 
 
197 aa  177  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  51.38 
 
 
217 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  51.38 
 
 
214 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  51.38 
 
 
214 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  54.64 
 
 
206 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  51.38 
 
 
214 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  50.26 
 
 
210 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  50.28 
 
 
198 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  51.38 
 
 
217 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>