More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1368 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  55.84 
 
 		 198 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  54.35 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  52.31 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 208 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  51.38 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  54.35 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  54.35 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  46.77 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  54.35 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.02 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  51.4 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  52.04 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  51.3 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  51.81 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  51.34 
 
 		 201 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  53.01 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  53.01 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.3 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  43.07 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  51.1 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  52.66 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  43.56 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  55.1 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  46.77 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  48.5 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 240 aa  161  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  50.26 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  161  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 268 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  47.76 
 
 		 283 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  51.32 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  49.45 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  46.19 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.06 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 197 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  45.77 
 
 		 338 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  43 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  46.27 
 
 		 283 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.66 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  45.81 
 
 		 308 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  46.38 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  48.54 
 
 		 260 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  44.61 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  44.79 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  50 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  46.2 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>