More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_686 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  97.63 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  84.29 
 
 		 212 aa  358  3e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  54.73 
 
 		 260 aa  201  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  50.49 
 
 		 277 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  51.49 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  51.27 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  53.16 
 
 		 219 aa  187  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 255 aa  187  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  48.76 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  46.01 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  49.01 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  49.24 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 257 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  47.24 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  50.74 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  45.96 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  48.98 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  49.05 
 
 		 260 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 283 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  50.52 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  45.41 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  48.73 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  49.24 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.02 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  48.73 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  48.22 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  48.22 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  48.22 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  46.38 
 
 		 308 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  52.33 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 230 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  43.68 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 338 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  45.08 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  45.41 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.78 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  48.47 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  44.78 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  43.4 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  46.6 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1844  ribonuclease HII  48.08 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  42 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  44.39 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  43.98 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  44.97 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  47.15 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  44.26 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  41.83 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 208 aa  151  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 258 aa  151  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  42.33 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  42.33 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  42.33 
 
 		 198 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  43.32 
 
 		 202 aa  150  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  43.72 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  43.07 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  42.33 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  42.33 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  45.79 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  46.28 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  43.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  40.51 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  41.54 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>