More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0224 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  51.76 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  48.76 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  48.26 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  51.26 
 
 		 224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1844  ribonuclease HII  50.24 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  46.27 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 256 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 257 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.5 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  45.23 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.22 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  41.24 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.94 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  44.06 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  43.22 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.47 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 217 aa  154  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  47.29 
 
 		 260 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  46.67 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  45.08 
 
 		 254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  42.08 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  41.21 
 
 		 253 aa  151  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  45.18 
 
 		 214 aa  150  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  48 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 253 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  43.88 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  40.86 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  47.5 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 259 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  43.46 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  43.46 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  41.84 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  39.06 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0447  Ribonuclease H  43.84 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00050563  normal  0.0103792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  47.06 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  45.99 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  41.29 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  46.63 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  44.97 
 
 		 240 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  42.64 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  42 
 
 		 258 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 240 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  42.93 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  35.18 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 198 aa  138  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  43.92 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  42.79 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  43.78 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  42.33 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  44.79 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 248 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  42.62 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.15 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  44.51 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  44.32 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  43.94 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>