More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3045 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  100 
 
 		 233 aa  470  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  100 
 
 		 233 aa  470  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  54.82 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  55.38 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  54.31 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 242 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  51.53 
 
 		 277 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  56.92 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  55.1 
 
 		 208 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  50 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  52.88 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  50 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  50.76 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  51.76 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  54 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  54.31 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  50 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  54.97 
 
 		 210 aa  185  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  49.24 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  57.65 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.24 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  54.12 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  52.58 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  53.97 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  47.98 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  51.4 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  49.27 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.69 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  48.31 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  50.76 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  50.76 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 257 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  51.91 
 
 		 221 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2303  ribonuclease HII  53.4 
 
 		 195 aa  165  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000380421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  50.76 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  49.24 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  50.26 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  49.17 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  48.22 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  48.7 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 338 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 198 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 214 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 202 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 202 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 249 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.37 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  48.69 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  47.45 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  44.62 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  50.53 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  50.77 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  50.84 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>