More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1292 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 253 aa  188  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 253 aa  187  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 256 aa  185  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  47.46 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 257 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.59 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 256 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 257 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.54 
 
 		 204 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 257 aa  160  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  43.26 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 257 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 257 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 198 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  47.54 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 198 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  48.09 
 
 		 198 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 257 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  43.46 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  41.4 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  45.81 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 257 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  42.62 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  46.07 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  41.88 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  42.31 
 
 		 221 aa  152  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  46.93 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  42.62 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  43.62 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  46.37 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.89 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  46.29 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  45.08 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  44.38 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  44.56 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  42.78 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  44.57 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  44.94 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  44.07 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.46 
 
 		 227 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  44.07 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  44.26 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  43.17 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  48.88 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.43 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  42.33 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  41.15 
 
 		 255 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  41.75 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  46.33 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>