More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2303 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2303  ribonuclease HII  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000380421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  53.12 
 
 		 256 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  53.72 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  51.83 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.52 
 
 		 242 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  51.87 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  53.72 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  53.12 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 257 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 257 aa  187  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  51.04 
 
 		 277 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  55.5 
 
 		 213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  48.17 
 
 		 255 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  49.48 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 255 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  51.4 
 
 		 191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  51.04 
 
 		 210 aa  177  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.17 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  52.85 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  52.78 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  54.79 
 
 		 230 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 255 aa  175  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  48.45 
 
 		 308 aa  174  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  51.85 
 
 		 267 aa  174  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  51.11 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.17 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 250 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  54.26 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 257 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  48.69 
 
 		 253 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  51.83 
 
 		 257 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  51.38 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  53.4 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  53.4 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  47.51 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 257 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  52.88 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 212 aa  167  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  51.12 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 211 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.9 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.88 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 283 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.31 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  48.86 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  43.98 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 283 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  44.27 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  48.6 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  44.97 
 
 		 283 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  49.43 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 198 aa  161  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  47.75 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  48.17 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.3 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  49.44 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  44.15 
 
 		 338 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  48.59 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.31 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  47.73 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.46 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  45.05 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.75 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  48.59 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  48.86 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  48.17 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.31 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  48.31 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  49.15 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>