More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0388 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  61.4 
 
 		 220 aa  248  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  61.47 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  60.93 
 
 		 220 aa  244  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  57.69 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  56.22 
 
 		 229 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  54.85 
 
 		 229 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  55.56 
 
 		 210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  58.88 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 257 aa  187  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  51.55 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  50.48 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  49.05 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.58 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.76 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  50.25 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  49.02 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.02 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 277 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  52.41 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  50.77 
 
 		 257 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 206 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.22 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  47.06 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  49.23 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 259 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  46.91 
 
 		 255 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  50.77 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  52.33 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  51.56 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  43.23 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 201 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  50.54 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  45.69 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  48.1 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  45.81 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.32 
 
 		 268 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 207 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.74 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  50.82 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.9 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  43.65 
 
 		 308 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  50 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.95 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  46.52 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  50.27 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.31 
 
 		 198 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  50 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  46.12 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  50 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  44.98 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>