More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0703 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  65.12 
 
 		 220 aa  261  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  64.65 
 
 		 220 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  63.72 
 
 		 220 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  59.64 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  57.69 
 
 		 222 aa  241  9e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  58.72 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  59.52 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  61.61 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  55.17 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  53.4 
 
 		 208 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  54.27 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  54.27 
 
 		 212 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  51.27 
 
 		 199 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 292 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  48.68 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  49.5 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  52 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  53.85 
 
 		 199 aa  168  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  51.24 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  45.6 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  48.46 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.26 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  52.2 
 
 		 201 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 240 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.92 
 
 		 308 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 210 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  49.3 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  52.76 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  50 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  49.25 
 
 		 228 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  51.4 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  48.26 
 
 		 307 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.97 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  48.73 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.26 
 
 		 213 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 201 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  47.09 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1266  ribonuclease HII  53.81 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  51.02 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 201 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.09 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  43.13 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  47.87 
 
 		 208 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  45.45 
 
 		 204 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 211 aa  155  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.37 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  44.19 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  49.45 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  50.28 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  47.25 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  50 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  44.85 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  44.88 
 
 		 204 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>