More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1834 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  100 
 
 		 228 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  67.36 
 
 		 241 aa  294  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  63.5 
 
 		 307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  61.27 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  65.57 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  60.98 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  59.9 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  63.94 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  62.98 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  61.58 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  61.65 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  65.02 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  57.27 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  57.78 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  58.49 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  59.33 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  59.33 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  59.33 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  59.13 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  58.65 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  54.59 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  50.77 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  45.31 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  51.83 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  54.14 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.37 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 279 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 257 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 202 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  40.21 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 202 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  52.55 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  42.36 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  43.2 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  41.88 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  37.56 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  43.84 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  49.25 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  49.16 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  40.96 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  46.97 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  42.41 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.13 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.31 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.94 
 
 		 268 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 260 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1252  Ribonuclease H  50.28 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.579547 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  39.69 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  40.1 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  46.27 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  47.94 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  42.41 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>