More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  100 
 
 		 275 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  67.12 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  62.33 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  61.9 
 
 		 228 aa  234  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  63.77 
 
 		 239 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  63.77 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  63.77 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  62.96 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  62.8 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  60.39 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  58 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  55.65 
 
 		 270 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  59.05 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  56.19 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  58.41 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  59.81 
 
 		 228 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  56.19 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  57.35 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  54.13 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  58.29 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  57.8 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  55.94 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.76 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.76 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 206 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.24 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 210 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 214 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.39 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  43.93 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  43.93 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 217 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.35 
 
 		 198 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  50 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  50 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  44.93 
 
 		 208 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  43.88 
 
 		 210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 214 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 214 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 214 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 214 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 214 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 214 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 214 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  40.74 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  43.16 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  44.72 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  42.11 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  45.3 
 
 		 193 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 220 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 198 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 220 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  47.28 
 
 		 198 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  44.19 
 
 		 218 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 198 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  45.41 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 198 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 198 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  43.92 
 
 		 203 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  42.49 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 198 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  45.83 
 
 		 202 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  39.9 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 198 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  41.88 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  43.55 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  43.37 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  45.96 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  43.02 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  45.03 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  45.77 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  43.08 
 
 		 229 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 198 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  43.08 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  47.51 
 
 		 197 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  46.74 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>