More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2783 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  81.68 
 
 		 224 aa  333  9e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1844  ribonuclease HII  57.77 
 
 		 212 aa  208  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  54.46 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  51.49 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  51.76 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50.49 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  50 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  52.76 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  51.23 
 
 		 277 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  51.85 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 260 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  48.06 
 
 		 268 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  51.94 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  50.77 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  50.24 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  48.6 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  55.44 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.34 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  39.44 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  48 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  49.47 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  161  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  44 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 212 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  50.8 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  47.26 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  40.58 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  48.37 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  44.1 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 198 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  48.37 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  47.74 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.27 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  49 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  50.27 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  48.34 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 203 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  44.55 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  45.73 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.77 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  47.74 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  48.63 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 209 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  45.67 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 209 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  47.74 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  46.23 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  47.74 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.26 
 
 		 308 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.09 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 205 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  44.83 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  44.83 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  45.83 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>