More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1844 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1844  ribonuclease HII  100 
 
 		 212 aa  420  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  57.77 
 
 		 227 aa  231  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  58.13 
 
 		 224 aa  226  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  50.24 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  48.08 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  47.6 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  49.25 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.53 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  49.5 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  50.5 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 242 aa  168  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.5 
 
 		 216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  49.27 
 
 		 260 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  50.72 
 
 		 260 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  48.33 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  52.85 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.22 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.8 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  45.5 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  41.54 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  45.77 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  40.39 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  45.6 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 254 aa  155  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  51.49 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  45.9 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.18 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  41.09 
 
 		 253 aa  154  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  42.72 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  50.82 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.77 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  48 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.77 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  44.5 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  50 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.87 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 279 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  52.85 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  41.75 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  45.6 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  38.65 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  45.55 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  43.72 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  46.63 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  45.05 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  44.61 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  41.54 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  44.66 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 257 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  41.36 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.24 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  40.96 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  40.96 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  41.97 
 
 		 204 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  41.94 
 
 		 203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1176  Ribonuclease H  48.11 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  43.68 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  46.52 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1460  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  43.59 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  41.26 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>