More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1166 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48 
 
 
277 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  51.98 
 
 
213 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  46.11 
 
 
255 aa  179  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  49.25 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  51.52 
 
 
206 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.22 
 
 
257 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  52.71 
 
 
212 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  52.71 
 
 
212 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  46.73 
 
 
257 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  48.04 
 
 
198 aa  171  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.42 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  54.95 
 
 
198 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  43.37 
 
 
253 aa  168  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  45.5 
 
 
242 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  50.27 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  51.46 
 
 
218 aa  165  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  49.01 
 
 
260 aa  164  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  51.69 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.73 
 
 
214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  47.03 
 
 
253 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  47.74 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  49.24 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  51.23 
 
 
212 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  50.28 
 
 
254 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  47.47 
 
 
210 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  50.82 
 
 
197 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  46.88 
 
 
250 aa  162  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  49.24 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  47.45 
 
 
210 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  48.31 
 
 
191 aa  161  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  53.37 
 
 
198 aa  161  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  44.62 
 
 
256 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  49.24 
 
 
236 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.13 
 
 
202 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  47.52 
 
 
260 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.24 
 
 
230 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.62 
 
 
256 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  48.22 
 
 
232 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  47.69 
 
 
259 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  47.94 
 
 
216 aa  158  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  42 
 
 
255 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  42 
 
 
255 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.25 
 
 
211 aa  158  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  45.59 
 
 
240 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  50 
 
 
198 aa  158  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  45.76 
 
 
197 aa  157  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  49.73 
 
 
198 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  47.72 
 
 
257 aa  157  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  47.57 
 
 
201 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  47.4 
 
 
227 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  46.73 
 
 
257 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.21 
 
 
257 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  46.73 
 
 
257 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  48.22 
 
 
257 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  43.56 
 
 
209 aa  156  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  46.94 
 
 
225 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  42 
 
 
211 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  47.18 
 
 
257 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  47.18 
 
 
257 aa  155  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  48.66 
 
 
214 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  48.7 
 
 
226 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  46.19 
 
 
216 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50.81 
 
 
201 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50 
 
 
209 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50 
 
 
209 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  47.59 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  51.4 
 
 
198 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  47.26 
 
 
235 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.11 
 
 
201 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  48.66 
 
 
198 aa  154  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  44.93 
 
 
215 aa  154  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  48.66 
 
 
198 aa  154  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  41.5 
 
 
211 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.23 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.69 
 
 
202 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  49.47 
 
 
201 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  43.28 
 
 
283 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  44.97 
 
 
256 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  46.38 
 
 
210 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.69 
 
 
202 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  47.85 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  48.94 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  46.52 
 
 
204 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  45.96 
 
 
208 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1273  Ribonuclease H  43.22 
 
 
219 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.83 
 
 
207 aa  151  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  45.03 
 
 
203 aa  151  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  45.05 
 
 
199 aa  151  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  41.87 
 
 
212 aa  151  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.78 
 
 
217 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  43.65 
 
 
208 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  52.43 
 
 
226 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  46.32 
 
 
213 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  44.12 
 
 
221 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.67 
 
 
214 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  46.08 
 
 
269 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  42.29 
 
 
283 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  42.29 
 
 
283 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>