More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0812 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  100 
 
 		 256 aa  526  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  64.71 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  64.71 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.43 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  52.94 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  51.19 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.44 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  49.41 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  48.43 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  49.61 
 
 		 257 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  49.61 
 
 		 257 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  48.82 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  48.82 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  48.82 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  47.93 
 
 		 217 aa  198  7e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  43.91 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  43.37 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  41.25 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  39 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  43.6 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  48.47 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  48.37 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  36.86 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  45.55 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  47.31 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 207 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  37.7 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  45.91 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  48.13 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  43.81 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  46.45 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  44.12 
 
 		 213 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  45.5 
 
 		 193 aa  168  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  44.92 
 
 		 227 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  45.9 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  47.73 
 
 		 209 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  36.9 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  45.59 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  46.32 
 
 		 203 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 242 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.19 
 
 		 203 aa  164  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  48.11 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  48.13 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.28 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  45.11 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  44.02 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 214 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  51.37 
 
 		 194 aa  162  6e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 198 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  42.05 
 
 		 208 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  40.8 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  44.57 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  42.35 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  42.35 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  44.57 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 198 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 214 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  40.31 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 191 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 214 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  43.81 
 
 		 214 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>