More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1481 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  61.5 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  61.2 
 
 		 198 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  61.75 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  60.43 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  60.43 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  60.43 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  60.66 
 
 		 198 aa  211  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  59.89 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  60.22 
 
 		 197 aa  210  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  59.36 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  59.89 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  60.66 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  61.2 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  61.2 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  60.87 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  61.2 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  60.66 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  60.87 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  55.79 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  59.56 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  60.66 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  58.29 
 
 		 198 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  58.29 
 
 		 198 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  58.82 
 
 		 191 aa  208  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  60.33 
 
 		 198 aa  208  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  57.87 
 
 		 201 aa  208  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  57.75 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  62.09 
 
 		 202 aa  204  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  58.06 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  57.84 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  56.52 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  56.52 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  57.29 
 
 		 214 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  56.59 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  58.7 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  58.6 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  56.54 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  55.03 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  62.37 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  56.83 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  53.09 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  53.09 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  54.75 
 
 		 268 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  52.31 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  56.67 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  55.03 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  50.51 
 
 		 193 aa  187  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  53.81 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  52.97 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  54.17 
 
 		 208 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  58.15 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  50.53 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  56.83 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 197 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  52.33 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  59.46 
 
 		 196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  54.19 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  52.36 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  56.11 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  52.43 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  59.02 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  56.67 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  57.84 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  56.11 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 190 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  52.53 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  55.56 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  54.1 
 
 		 283 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  55.32 
 
 		 196 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1176  Ribonuclease H  54.64 
 
 		 196 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1460  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 196 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  55 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  52.69 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  54.45 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  56.76 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  56.76 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  54.45 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 283 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  52.24 
 
 		 236 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  53.55 
 
 		 283 aa  177  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  55.19 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  54.84 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  53.4 
 
 		 338 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  46.89 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  55.38 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0799  RNase HII  58.1 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  54.35 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  55.38 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  55.38 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  56.22 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  55.62 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  54.84 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  54.3 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  54.84 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 208 aa  174  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  53.19 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>