More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1702 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  100 
 
 
242 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  58.03 
 
 
256 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  53.62 
 
 
277 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  50 
 
 
255 aa  221  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  52.43 
 
 
255 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  53.17 
 
 
254 aa  204  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50 
 
 
257 aa  204  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  44.76 
 
 
268 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  54.69 
 
 
206 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  50.52 
 
 
230 aa  201  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  52.91 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  51.6 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  51.79 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  50.48 
 
 
308 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  48.44 
 
 
219 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  51.6 
 
 
250 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.44 
 
 
214 aa  191  6e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  40.4 
 
 
267 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.12 
 
 
204 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  51.04 
 
 
216 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  50 
 
 
260 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  49.74 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  49.76 
 
 
272 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  45.23 
 
 
283 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  50.26 
 
 
217 aa  187  1e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  50.78 
 
 
213 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  49.76 
 
 
272 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  44.22 
 
 
283 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  50.51 
 
 
255 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  54.79 
 
 
259 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  43.94 
 
 
283 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  43.94 
 
 
338 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  57.61 
 
 
197 aa  185  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  49.21 
 
 
209 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  50.52 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  46.88 
 
 
227 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  51.47 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  52.79 
 
 
203 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  48.48 
 
 
206 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  51.47 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  50.98 
 
 
257 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  51.96 
 
 
257 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  47.94 
 
 
207 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  48.21 
 
 
206 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  45.21 
 
 
253 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  51.96 
 
 
257 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  51.96 
 
 
257 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  48.37 
 
 
198 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  49.48 
 
 
233 aa  178  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  49.48 
 
 
233 aa  178  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  51.47 
 
 
257 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  46.81 
 
 
198 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.03 
 
 
210 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.15 
 
 
201 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  47.87 
 
 
201 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  48.66 
 
 
218 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  47.18 
 
 
205 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  47.37 
 
 
211 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  50 
 
 
257 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  49.47 
 
 
217 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  50 
 
 
211 aa  175  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  49.43 
 
 
197 aa  175  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.32 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  45.55 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.56 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.9 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  47.09 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  48.44 
 
 
198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  44.95 
 
 
210 aa  172  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.09 
 
 
211 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  46.51 
 
 
299 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  47.09 
 
 
230 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  51.27 
 
 
199 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  47.19 
 
 
240 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  45.99 
 
 
220 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  46.56 
 
 
207 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  45.83 
 
 
224 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  50 
 
 
193 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.88 
 
 
235 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50.28 
 
 
202 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50.28 
 
 
202 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl537  ribonuclease HII, primer excision  53.37 
 
 
208 aa  169  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000093074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  50.28 
 
 
209 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  48.3 
 
 
199 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  48.35 
 
 
208 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  50.27 
 
 
212 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  47.12 
 
 
213 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  47.54 
 
 
225 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  49.19 
 
 
203 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  49.18 
 
 
198 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  46.67 
 
 
198 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  46.99 
 
 
207 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  50.28 
 
 
196 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  50 
 
 
209 aa  167  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  46.67 
 
 
198 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  47.54 
 
 
207 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  46.67 
 
 
198 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  46.67 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  45.5 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  44.75 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>