More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2485 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  100 
 
 		 198 aa  406  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  55.84 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  52.66 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  55.06 
 
 		 191 aa  187  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  55.32 
 
 		 202 aa  187  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  54.64 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  45.81 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  51.32 
 
 		 268 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  53.65 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 277 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  46.39 
 
 		 257 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  53.67 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  54.8 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  52.51 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 242 aa  177  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  50 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  53.63 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  56.74 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  56.18 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  55.62 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 229 aa  175  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  48 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  53.07 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  53.67 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  50 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  53.67 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  53.67 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  52.69 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  48.99 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  52.54 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  52.54 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  52.54 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  52.51 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  52.51 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  52.11 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  52.54 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  52.54 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 230 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  51.63 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  47.46 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  51.58 
 
 		 283 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  55.06 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  51.08 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  56.74 
 
 		 196 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  55.06 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  46.31 
 
 		 221 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  50.57 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  44.97 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 257 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  54.24 
 
 		 218 aa  168  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 250 aa  168  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  48.69 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  54.49 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  54.49 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 257 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  52.81 
 
 		 194 aa  167  9e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 208 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  52.22 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  45.3 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  54.75 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  46.7 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 257 aa  165  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 253 aa  165  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>