More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3310 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  65.1 
 
 		 197 aa  252  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  60.42 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 220 aa  214  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  52.88 
 
 		 263 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  58.29 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  51.3 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  52.2 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  52.69 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  60.57 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  55.62 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  53.59 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 201 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  51.12 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  53.63 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  49.26 
 
 		 199 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  52.58 
 
 		 338 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  54.6 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  50.52 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  51.4 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  54.24 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  53.85 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  55.17 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  56.57 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  53.59 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  51.08 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  51.4 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  54.49 
 
 		 268 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  52.25 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  50.78 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  54.49 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 250 aa  167  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 249 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  52.51 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  52.51 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  52.51 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  50 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  50.82 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  48.88 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.59 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.86 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  52.57 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  46.41 
 
 		 199 aa  165  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  52.49 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  52.49 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  47.51 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50.86 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  55.06 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  48 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  48 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  50.52 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48 
 
 		 257 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  51.12 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  45.11 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  50.29 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  53.14 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.6 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  46.86 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  43.26 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>