More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3486 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  96.09 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  66.04 
 
 		 216 aa  280  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  72.22 
 
 		 213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  65.55 
 
 		 217 aa  255  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  64.68 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  62.68 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  58.49 
 
 		 209 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  56.19 
 
 		 256 aa  222  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  58.52 
 
 		 254 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  53.03 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  54.97 
 
 		 255 aa  207  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.52 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  55.73 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  53.23 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  49.51 
 
 		 277 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  51.01 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.47 
 
 		 214 aa  198  7e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  51.02 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  50.74 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  54.1 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  51.98 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  50.77 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  56.32 
 
 		 257 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  56.84 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  56.32 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  51.6 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  54.04 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  50.76 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.72 
 
 		 259 aa  184  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  52.25 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  50.54 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  52.33 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  55.79 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  55.79 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  54.77 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  56.32 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  55.79 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  48.74 
 
 		 308 aa  182  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  55.26 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 250 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  55.03 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  54.31 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  54.31 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  53.04 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  51.96 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  52.25 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  47.11 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  48.97 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  52.88 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  50 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 198 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  52.6 
 
 		 206 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 283 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  51.96 
 
 		 235 aa  174  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 292 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.44 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  49.04 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  46.8 
 
 		 218 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  49.23 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  51.38 
 
 		 199 aa  172  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  48.5 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  50.54 
 
 		 204 aa  171  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  50 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  50.27 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 248 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  52.78 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>