More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0974 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  55.73 
 
 		 256 aa  217  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  54.69 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  51.01 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  51.5 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  48.17 
 
 		 210 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  53.67 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  51.08 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  49.74 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  53.67 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  53.98 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  53.98 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  53.98 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  53.98 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  53.98 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  53.11 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 214 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 214 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 214 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  53.16 
 
 		 272 aa  190  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  53.16 
 
 		 272 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 268 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  48.99 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  57.53 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  49.48 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.72 
 
 		 198 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50.85 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  55.26 
 
 		 197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 254 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.97 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  49.74 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  48.69 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  52.91 
 
 		 308 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  50.53 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 250 aa  178  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 202 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  48.88 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  52.78 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  47.64 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  45.99 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  48.59 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  42.56 
 
 		 307 aa  175  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.52 
 
 		 277 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  46.53 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  47.83 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  46.15 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  46.59 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  47.16 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  51.34 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  46.89 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 253 aa  171  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  46.74 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.19 
 
 		 198 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>