More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0018 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  100 
 
 		 207 aa  433  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  61.39 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  64.85 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  60.29 
 
 		 205 aa  255  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  64.47 
 
 		 208 aa  254  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  64 
 
 		 206 aa  254  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  59.7 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 256 aa  184  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  52.49 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  51.79 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  51.34 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.53 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 250 aa  171  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  52.49 
 
 		 201 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  46.67 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  47.51 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 283 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 338 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  49.45 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 283 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 209 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 209 aa  167  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  167  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  51.04 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  49.18 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  48.39 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  46.11 
 
 		 283 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  50 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50.27 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  48.44 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 255 aa  165  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  49.17 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  51.4 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  44.9 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  46.49 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  48.63 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  54.7 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  48.42 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 197 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 248 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 253 aa  161  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  46.52 
 
 		 197 aa  161  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  50 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.67 
 
 		 277 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  43.81 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  47.31 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  47.89 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 249 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>