More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3752 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.45 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  50.2 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  51.18 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  49.61 
 
 		 257 aa  234  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  49.23 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  48.08 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  56.04 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  54.11 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  46.83 
 
 		 253 aa  223  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  49.81 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  54.73 
 
 		 211 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  58.51 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  54.23 
 
 		 211 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  58.46 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.16 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  52.91 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  48.83 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  50.58 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  50.9 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  46.69 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  55.05 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  58.7 
 
 		 201 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  57.3 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  47.35 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  59.02 
 
 		 208 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  52.26 
 
 		 212 aa  205  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  51.33 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  54.17 
 
 		 211 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  55.91 
 
 		 211 aa  205  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  55.74 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  56.98 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  56.99 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  54.3 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  56.99 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  56.83 
 
 		 209 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  56.83 
 
 		 209 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  57.69 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  53.12 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  54.17 
 
 		 203 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  56.04 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  55.19 
 
 		 199 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  55.49 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  44.09 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  52.17 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  51.52 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  59.12 
 
 		 217 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  54.3 
 
 		 210 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 214 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  45.25 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  52.38 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  54.05 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  52.15 
 
 		 198 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  52.15 
 
 		 198 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  51.89 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  52.15 
 
 		 198 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  55.56 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  52.15 
 
 		 198 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  52.15 
 
 		 198 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  52.15 
 
 		 193 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  53.51 
 
 		 207 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  55 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  55.62 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  56.11 
 
 		 207 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 198 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  55.91 
 
 		 214 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 198 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  55 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  55.15 
 
 		 209 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 198 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  56.57 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  51.34 
 
 		 206 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  54.14 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  52.69 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  54.87 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>