More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1554 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  100 
 
 		 307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  67.5 
 
 		 232 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  60.71 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  63.27 
 
 		 240 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  65.66 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  63.5 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  64.29 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  63.05 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  61.69 
 
 		 240 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  65.31 
 
 		 240 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  59.62 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  61.62 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  61.62 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  61.62 
 
 		 239 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  61.86 
 
 		 249 aa  212  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  63.44 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  54.95 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  60.61 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  57.29 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  59.3 
 
 		 211 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  57.14 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  55 
 
 		 228 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  55.8 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  54.89 
 
 		 209 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  54.89 
 
 		 209 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 209 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  49.52 
 
 		 229 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  42.56 
 
 		 206 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 207 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  54.3 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 199 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  51.32 
 
 		 198 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  47.44 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  50 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  44.55 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  52.69 
 
 		 198 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  53.8 
 
 		 234 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  45.6 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  45.37 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 234 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 214 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 214 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 214 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.04 
 
 		 257 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45 
 
 		 217 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  45.7 
 
 		 193 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 248 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  51.61 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 201 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 206 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 201 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  38.89 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 210 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  45 
 
 		 230 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  46.53 
 
 		 199 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  46.15 
 
 		 204 aa  162  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 214 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 212 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  49.75 
 
 		 214 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  48.36 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  49.46 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.06 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 214 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 214 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 214 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 214 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  46.89 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  43.09 
 
 		 198 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  39.91 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.22 
 
 		 202 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 214 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 197 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 214 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>