More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0516 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  93.01 
 
 		 229 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  68.98 
 
 		 279 aa  283  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  70.51 
 
 		 216 aa  275  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  58.29 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  59.52 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  59.81 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  59.81 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  54.85 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0507  ribonuclease HII  57.48 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.140576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  58.38 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  52.74 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  52.48 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  54.36 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  53.2 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  51.02 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  54.55 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  54.55 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  55 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  55.31 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  49.75 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.64 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  51.01 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  48.97 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  52.28 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  54.08 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  47.44 
 
 		 307 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  53.33 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  48.57 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1081  ribonuclease HII  53.4 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1208  ribonuclease HII  52.91 
 
 		 298 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.621532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1266  ribonuclease HII  52.5 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.99 
 
 		 204 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45.97 
 
 		 268 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  52.15 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  50.55 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  49.75 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  50.24 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  44.23 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1226  ribonuclease HII  51.21 
 
 		 281 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  50.26 
 
 		 202 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  49.73 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  50 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 218 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  45.37 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  46.81 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  50 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  48.97 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  46.92 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  50 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>