More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0717 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  56.86 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.47 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  52.2 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  49.78 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  54.97 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  54.97 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  51.01 
 
 		 206 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  53.2 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  43.97 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  47.64 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  51.85 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.58 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  46.09 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  46.09 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  46.09 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.09 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  45.7 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  53.89 
 
 		 213 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51 
 
 		 214 aa  198  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  54.97 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  47.35 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  51.83 
 
 		 208 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  43.58 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  47.44 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  50 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  44.98 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  53.68 
 
 		 209 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  52.53 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  45.23 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  46.23 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  40.4 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  45.23 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  52.25 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.69 
 
 		 201 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  51.27 
 
 		 199 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  50 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  52.84 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  48.17 
 
 		 197 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  52.27 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  50 
 
 		 206 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.69 
 
 		 217 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 211 aa  178  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 207 aa  178  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.12 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  51.7 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.14 
 
 		 202 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.12 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  51.69 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  46.86 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.14 
 
 		 202 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  46.86 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  51.12 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  49.74 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  46 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.32 
 
 		 211 aa  175  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50 
 
 		 199 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  52.46 
 
 		 197 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  52.27 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  52.27 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.86 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  50.57 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  52.88 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  52.88 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  42.51 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  48.86 
 
 		 197 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  51.7 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  47.59 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  51.14 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  48.35 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  49.16 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  49.72 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  52.81 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  41.2 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.11 
 
 		 202 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  45.74 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  46.24 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>