More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1478 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50 
 
 		 242 aa  221  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  51.17 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.96 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  52.26 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  50 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  49.5 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  49.01 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  56.04 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  49.5 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  48.74 
 
 		 219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  51.64 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  50.7 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  50.7 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  49.5 
 
 		 268 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  50.7 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  50.7 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  50.7 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  50.7 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  49.28 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 206 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  46.26 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  51.02 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  52.71 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  51.76 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  49.19 
 
 		 197 aa  186  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  52.26 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.48 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  48.02 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  51.27 
 
 		 208 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 201 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  46.31 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 213 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 201 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  49.72 
 
 		 203 aa  171  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  50.74 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.2 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.39 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  45.83 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  49.75 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  48.9 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 212 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 213 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 211 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 207 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  45.41 
 
 		 211 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  48.88 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 206 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  45.13 
 
 		 204 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  46.97 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.49 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  50 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  45.31 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 207 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 207 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  46.6 
 
 		 193 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  47.85 
 
 		 209 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 208 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  46.91 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  44.33 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  48.24 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  45.64 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  48.33 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  43.78 
 
 		 190 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>