More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0664 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  52.23 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  50.4 
 
 		 338 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  49.6 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  48.79 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  58.1 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  54.27 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  53.97 
 
 		 204 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  42.11 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  53.67 
 
 		 198 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  54.8 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  56.98 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  54.24 
 
 		 201 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 206 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  48.24 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  44.05 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  39.84 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  57.54 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  54.75 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.26 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  57.54 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50.71 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  55.87 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  54.24 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  50 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  52.43 
 
 		 208 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  48.36 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  39.36 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  37.8 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  52.54 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  41.13 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  40.15 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  52.51 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  51.02 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.11 
 
 		 201 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  53.11 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  49.72 
 
 		 197 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  42.48 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  41.2 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  53.11 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  54.73 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  52.55 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  42.61 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  50.57 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  53.11 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  51.03 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  52.54 
 
 		 191 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  46.6 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  50.51 
 
 		 202 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 213 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  53.63 
 
 		 209 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  51.98 
 
 		 202 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 203 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  48.02 
 
 		 212 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  49.72 
 
 		 193 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 207 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 219 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  36.48 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  50.52 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  39.36 
 
 		 257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  51.56 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  45.77 
 
 		 203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  49.46 
 
 		 221 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50.85 
 
 		 218 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 214 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 214 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  49.72 
 
 		 227 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  55.93 
 
 		 226 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0799  RNase HII  56.91 
 
 		 204 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  50 
 
 		 248 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 214 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  52.79 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  42.29 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  49.43 
 
 		 201 aa  161  9e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.25 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 198 aa  161  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  51.52 
 
 		 209 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  51.41 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>